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壽命能推算嗎?加州大學(xué)科學(xué)家提出“預(yù)測方法”

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來源:中國科學(xué)報
  2018-11-16
但若要延緩衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)生物統(tǒng)計學(xué)家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)發(fā)現(xiàn)了一種預(yù)測一個人生命周期的方法

       從古至今,從國內(nèi)到國外,從煉丹術(shù)到現(xiàn)代科學(xué),長生不老似乎一直是人類樂此不疲的追求。

       但若要延緩衰老,首先要弄清是什么造成了衰老。近日,加州大學(xué)洛杉磯分校(UCLA)生物統(tǒng)計學(xué)家斯蒂夫·霍瓦特(Steve Horvath)發(fā)現(xiàn)了一種預(yù)測一個人生命周期的方法:基于300~500個DNA甲基化標(biāo)記,比較一個人的身體與他的實際年齡,再觀察是在異常快速地衰老,還是異常緩慢地衰老,進(jìn)而推斷他的生命時間。

       基因上的衰老密碼

       其實,幾十年前霍瓦特的研究團(tuán)隊就開始了這項實驗,收集來自美國和歐洲超過13000人血液樣本中的DNA。然后,研究人員通過多種分子生物學(xué)方法,包括霍瓦特在2013年開發(fā)的表觀遺傳學(xué)時鐘(epigenetic clock)方法,測量了每個人的衰老速率。

       表觀遺傳時鐘是依照人體組織或體液的DNA甲基化修飾改變作為預(yù)測衰老的生物標(biāo)志物。這種方法可以通過追蹤DNA甲基化的改變計算血液和其他組織的衰老。在對比實際年齡與血液的生物學(xué)年齡之后,研究人員表示,這一方法可以預(yù)測每個人的預(yù)期壽命。

       兩年前,來自英國劍橋Babraham研究所和歐洲生物信息學(xué)研究所的研究人員也確定了一種小鼠表觀遺傳時鐘。研究人員根據(jù)小鼠基因組中329個位點的甲基化變化預(yù)測小鼠的年齡,其精確度控制在3.3周。基于這種精確度,再考慮到人類平均壽命是85年,而老鼠的平均壽命為3年??梢钥闯隼鲜蟮谋碛^遺傳時鐘精確度優(yōu)于5%。該結(jié)果發(fā)表在2017年《基因組生物學(xué)》(GenomeBiology)上。

       “小鼠表觀遺傳衰老時鐘是令人興奮的,因為這種表觀遺傳時鐘可能代表哺乳動物衰老的基本特征。如果可以鑒定人類表觀遺傳老化時鐘,將是老齡化領(lǐng)域的一個重大突破。”揚(yáng)州大學(xué)表觀遺傳學(xué)及表觀基因組學(xué)研究所所長、教授崔恒宓在接受《中國科學(xué)報》記者采訪時解釋說。

       但崔恒宓同時強(qiáng)調(diào):“根據(jù)以上研究結(jié)果表明,利用表觀遺傳時鐘預(yù)測衰老和壽命是可能的,但現(xiàn)在時機(jī)尚不成熟,有待于進(jìn)一步深入研究。”

       表觀遺傳學(xué)與衰老

       想要弄清表觀遺傳與衰老的直接關(guān)系,首先要理解表觀遺傳學(xué)的概念。它最早由生物學(xué)家Waddington在《現(xiàn)代遺傳學(xué)導(dǎo)論》一書中提出。1996年,美國科學(xué)家James G Herman 和Stephen B Baylin 發(fā)明甲基化特異性檢測技術(shù)(MSP),并通過該技術(shù)發(fā)現(xiàn)腫瘤細(xì)胞中抑癌基因啟動子區(qū)CpG呈高甲基化狀態(tài)。這使得科學(xué)家開始意識到DNA甲基化這種表觀遺傳信息在人類健康中的重要性。

       總的來說,表觀遺傳學(xué)是指在基因核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下,基因表達(dá)的可繼承變化。即一個生物體或細(xì)胞的性狀或特征,是特定的基因型與環(huán)境相互作用的結(jié)果,即使不改變DNA序列本身,也能改變基因的活性。表觀遺傳的主要功能是通過DNA甲基化、組蛋白修飾等調(diào)控基因的時空表達(dá)。表觀遺傳的現(xiàn)象很多,如基因組印記、母體效應(yīng)、X染色體失活等。

       “表觀遺傳其實有點像玻璃球跳棋中,棋盤上限制棋子移動并固定其位置的小圓坑。”中科院生物物理研究所研究員朱冰對《中國科學(xué)報》記者舉了個生動的例子。表觀遺傳體系的存在使得多細(xì)胞生物能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞的分化,從而產(chǎn)生具有同一個基因組的成百上千種不同類型的細(xì)胞;表觀遺傳體系還限制了細(xì)胞的隨意變化,使得細(xì)胞類型能穩(wěn)定在這成百上千種,而不是無限增加。這樣,人才能成為“合格的多細(xì)胞生物”。

       霍瓦特提出的表觀遺傳時鐘就是一種關(guān)于DNA甲基化狀態(tài)的算法,這種算法能非常準(zhǔn)確地估計年齡,這種判斷不僅僅根據(jù)細(xì)胞本身,也根據(jù)其生長環(huán)境。例如,白血球的存活周期可能只有幾天或數(shù)周,但它其中卻攜帶著捐贈者的生命特征。而且,除了白血球,從大腦、結(jié)腸以及許多其他器官提取的DNA也一樣含有人體的生命特征。這種判斷壽命的方法,其誤差僅在3.6年之內(nèi)。另外,如果捐獻(xiàn)者給出特定的組織,準(zhǔn)確性會更高,例如單獨給出唾液樣本,誤差縮小到2.7年之內(nèi);給出特定白血球,誤差則能控制在1.9年之內(nèi)等。

       對此研究,朱冰持保守看法:“這項研究目前還有點像先將箭射出,再在箭射中的位置畫個靶心,更多的研究尚有待完成。”他認(rèn)為,盡管實驗證明了表觀基因與衰老可能存在相關(guān)性,但并不能證明兩者存在因果性。

       研究衰老還需時間

       要研究衰老并不是件容易的事,因為衰老作為一種復(fù)雜的生命過程,許多因素參與調(diào)節(jié)并發(fā)揮重要作用,包括遺傳因素、表觀遺傳因素和環(huán)境因素等。更重要的是,目前的研究多在動物實驗中,但是一個物種的衰老機(jī)制與另一個物種是否相同也值得商榷。

       隨著表觀生命科學(xué)的發(fā)展,表觀遺傳學(xué)與衰老的關(guān)系已經(jīng)成為表觀遺傳學(xué)研究的重要內(nèi)容之一,“一個新的學(xué)科——《衰老表觀遺傳學(xué)》正在形成”。崔恒宓說。

       現(xiàn)在普遍認(rèn)為,除了遺傳因素對衰老起重要作用,表觀遺傳因素可能發(fā)揮的作用比想象的要大得多。表觀遺傳的改變可以導(dǎo)致基因表達(dá)的改變,并且可以遺傳至下一代。環(huán)境因素也會影響衰老。這包括營養(yǎng)缺乏、抽煙、飲酒等?,F(xiàn)有的研究已經(jīng)證實,這些環(huán)境因素可以通過影響表觀遺傳影響衰老,遺傳因素也會通過影響表觀遺傳影響衰老。

       目前,崔恒宓的研究也有涉及衰老的部分。“我們正在研究干細(xì)胞的抗衰老和衰老的表觀遺傳學(xué)機(jī)制。主要研究人間充質(zhì)干細(xì)胞干性維持和分化,并揭示間充質(zhì)干細(xì)胞的抗衰老、抗炎癥、調(diào)節(jié)免疫等的分子機(jī)制。此外,還進(jìn)行了腫瘤的表觀遺傳學(xué)研究。主要是破解腫瘤發(fā)生和發(fā)展的表觀遺傳學(xué)的分子機(jī)制,并力圖發(fā)現(xiàn)可用于腫瘤早期診斷的分子標(biāo)志物。”崔恒宓相信隨著相關(guān)研究的深入,該學(xué)科將不斷完善。

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