NGS（高通量測(cè)序）在腫瘤領(lǐng)域應(yīng)用途徑主要為液體活檢，腫瘤基因的液態(tài)活檢，即是在人體的循環(huán)血液中檢測(cè)ctDNA (死亡腫瘤細(xì)胞上脫落釋放的小片段腫瘤基因)、循環(huán)腫瘤細(xì)胞（CTC）以及外泌體等的技術(shù)。它通過(guò)體外無(wú)創(chuàng)抽血即可對(duì)全身的腫瘤信息進(jìn)行檢測(cè)，非常適合于癌癥的早期診斷和精準(zhǔn)醫(yī)療。其中，腫瘤基因檢測(cè)是極為重要的一部分。

       一、NGS檢測(cè)試劑盒介紹-精準(zhǔn)用藥

       同種癌癥由于具有不同突變特征，對(duì)于不同的藥耐受性不一樣，因此有必要在用藥前進(jìn)行腫瘤基因突變的檢測(cè)，進(jìn)而確定最適合的治療方案；傳統(tǒng)上對(duì)于腫瘤基因突變是利用腫瘤組織活檢或手術(shù)取得的組織標(biāo)本進(jìn)行檢測(cè)，目前的研究表明，ctDNA中的突變與腫瘤組織的突變具有很高的相似性，對(duì)血液中ctDNA 的分析可以幫助醫(yī)生判斷病人腫瘤的突變類型，制定用藥方針。

       腫瘤精準(zhǔn)用藥領(lǐng)域，液體活檢技術(shù)路徑主要包括PCR（尤其是ARMS-PCR）、基因芯片以及NGS等，其中PCR和芯片的優(yōu)勢(shì)主要在于檢測(cè)效率較高，成本相對(duì)較低，但主要劣勢(shì)在于只能針對(duì)特定突變位點(diǎn)進(jìn)行引物或者探針設(shè)計(jì)，有一定局限性；且檢測(cè)準(zhǔn)確度和靈敏度還有提升空間。而基于NGS的液體活檢可以使得檢測(cè)基因信息更為全面，盡管目前價(jià)格高于其他檢測(cè)方式。但是隨著技術(shù)的不斷提升，未來(lái)NGS將成為腫瘤精準(zhǔn)用藥領(lǐng)域的主流檢測(cè)方式。總的來(lái)說(shuō)，檢測(cè)方式將會(huì)從單基因到大Panel，檢測(cè)平臺(tái)將會(huì)從PCR到NGS。

       二、美國(guó)NGS檢測(cè)試劑盒盤(pán)點(diǎn)分析

       全球第一個(gè)NGS伴隨診斷試劑盒是2016年在美國(guó)上市。接下來(lái)，小編先盤(pán)點(diǎn)一下美國(guó)所上市的NGS檢測(cè)試劑盒。

       2016年12月19日，美國(guó)食品和藥物管理局（FDA）批準(zhǔn)了Foundation Medicine公司的FoundationFocusCDxBRCA產(chǎn)品，成為市場(chǎng)上第一個(gè)基于二代測(cè)序（NGS）的伴隨診斷試劑盒。用于鑒定攜帶BRCA突變的晚期卵巢癌患者，并指導(dǎo)Clovis Oncology公司生產(chǎn)的PARP抑制劑Rubraca（rucaparib）用藥，該藥物適用于已經(jīng)用兩種或更多種化療治療并且攜帶有害的BRCA1和BRCA2基因突變的晚期卵巢癌患者。(注：一年后FoundationOne CDx獲批后，此款產(chǎn)品已經(jīng)被整合進(jìn)大panel中,不是主打產(chǎn)品，甚至官網(wǎng)上都沒(méi)有了詳細(xì)資料)

       2017年6月23日，美國(guó)食品和藥物管理局（FDA）批準(zhǔn)了第二個(gè)基于NGS技術(shù)的伴隨診斷試劑盒Oncomine DX Target Test，此款產(chǎn)品由賽默飛世爾科技公司開(kāi)發(fā)，可以檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）患者中的三個(gè)基因的變異情況（BRAF，ROS1融合和EGFR突變），這是FDA批準(zhǔn)的第一個(gè)可篩查多個(gè)標(biāo)志物的腫瘤二代測(cè)序基因檢測(cè)。(注：原文有誤，其實(shí)是從病人FFPE的DNA和RNA中檢測(cè)23基因的突變)

       Oncomine DX Target Test可以用來(lái)診斷阿斯利康的易瑞沙（吉非替尼）、輝瑞的ALK和ROS1抑制劑Xalkori（crizotinib），以及諾華公司MEK抑制劑Mekinist（trametinib）和抑制劑Tafinlar（dabrafenib）這4種藥物的受試者。略顯遺憾的是，該產(chǎn)品并未覆蓋ALK融合基因檢測(cè)。

       2017年6月29日，美國(guó)食品和藥物管理局（FDA）宣布批準(zhǔn)Illumina公司與安進(jìn)公司（Amgen）基于MiSeqDx二代測(cè)序平臺(tái)合作開(kāi)發(fā)的伴隨診斷試劑盒——Extended RASPanel，可對(duì)KRAS基因和NRAS基因中的56個(gè)變異類型進(jìn)行分析，以確定患者能否受益于Amgen公司抗癌藥Vectibix（panitumumab）。(Vectibix于2006年9月首次獲FDA批準(zhǔn)，作為一種單藥療法，可用于具有野生型KRAS和NRAS基因的轉(zhuǎn)移性結(jié)腸直腸癌患者。)

       2017年11月15日，美國(guó)FDA宣布，已批準(zhǔn)紐約紀(jì)念斯隆·凱特琳癌癥研究中心（Memorial Sloan Kettering CancerCenter，MSK）基于二代測(cè)序技術(shù)（NGS）的癌癥基因檢測(cè)分析平臺(tái)MSK-IMPACTTM，為癌癥基因檢測(cè)未來(lái)的學(xué)術(shù)研究及商業(yè)開(kāi)發(fā)開(kāi)創(chuàng)了先河，進(jìn)一步拓寬了個(gè)體化醫(yī)療的道路。IMPACTTM是一種體外診斷檢測(cè)，采用NGS測(cè)序，能夠快速鑒定468種腫瘤相關(guān)基因的突變以及其他分子變化。它能夠檢測(cè)腫瘤組織中的體細(xì)胞單核突變/插入/缺失以及微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI），該檢測(cè)方法準(zhǔn)確率高達(dá)99%以上，可檢測(cè)到的突變頻率為5%（2%-5%）；對(duì)于其他分子檢測(cè)（MSI），IMPACTTM與傳統(tǒng)方法檢測(cè)結(jié)果的一致性高達(dá)92%以上。這是FDA所批準(zhǔn)的首個(gè)基于NGS檢測(cè)的大panel多基因檢測(cè)方法，腫瘤測(cè)序分析獲得了越來(lái)越廣泛的應(yīng)用和認(rèn)可，通過(guò)特定腫瘤中的基因突變能夠有效的幫助醫(yī)生和患者做出更有效的個(gè)性化治療方案。

       2017年11月30日，F(xiàn)DA批準(zhǔn)了Foundation Medicineqixia產(chǎn)品--FoundationOne CDx（F1CDx）用于泛癌癥臨床伴隨診斷，這是首款突破性的NGS伴隨診斷產(chǎn)品，能對(duì)任何實(shí)體腫瘤進(jìn)行診斷，在體外診斷領(lǐng)域具有里程碑式的意義。F1CDx覆蓋324個(gè)基因的遺傳突變以及兩類基因組特征，能夠高效檢測(cè)腫瘤基因的SNV、Indel、MSI以及TMB等。通過(guò)與FDA之前批準(zhǔn)的伴隨診斷對(duì)比，F(xiàn)1CDx的總體準(zhǔn)確率可達(dá)到94.6％。

       截止到2017年，美國(guó)共批準(zhǔn)了5個(gè)NGS檢測(cè)試劑盒，其中最為轟動(dòng)的便為斯隆凱特林癌癥研究中心研發(fā)的MSKCC-IMPACTTM 和Foundation Medicine研發(fā)的F1CDx，這兩種檢測(cè)試劑盒均為檢測(cè)多個(gè)基因，并且可以針對(duì)多種疾病。但是二者也有一些區(qū)別，其中F1CDx為伴隨診斷試劑盒，而MSKCC-IMPACTTM補(bǔ)充診斷試劑盒。

       從美國(guó)FDA批準(zhǔn)的5中NGS檢測(cè)試劑盒來(lái)看，從最初的檢測(cè)單個(gè)基因，針對(duì)單個(gè)疾病，適用于單個(gè)藥物，到F1CDx檢測(cè)數(shù)百個(gè)基因，檢測(cè)多種疾病，適用于多種藥物。僅僅在一年的時(shí)間里，便發(fā)生了如此大的變化，這都源于NGS技術(shù)的不斷革新，市場(chǎng)不斷擴(kuò)大和消費(fèi)者的認(rèn)知不斷提高。

       三、我國(guó)NGS檢測(cè)試劑盒盤(pán)點(diǎn)分析

       2018年7月23日，國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局CFDA批準(zhǔn)了廣州燃石的人EGFR/ALK/BRAF/KRAS基因檢測(cè)試劑盒，這是CFDA批準(zhǔn)的中國(guó)首個(gè)基于NGS的腫瘤伴隨診斷試劑盒，在我國(guó)體外診斷領(lǐng)域具有里程碑式的意義。

       2018年8月13日，國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理總局CFDA通過(guò)創(chuàng)新醫(yī)療器械特別審批通道，批準(zhǔn)了諾禾致源人EGFR/KRAS/BRAF/PIK3CA/ALK/ROS1基因突變檢測(cè)試劑盒（半導(dǎo)體測(cè)序法）的III類醫(yī)療器械上市。該產(chǎn)品批準(zhǔn)用于檢測(cè)非小細(xì)胞肺癌（NSCLC）患者腫瘤組織中與靶向治療密切相關(guān)的六個(gè)基因的突變狀態(tài)，篩選適合接受靶向藥物治療的患者。

       國(guó)內(nèi)NGS檢測(cè)公司目前已提前布局大panel產(chǎn)品的注冊(cè)申報(bào)工作，未來(lái)還將推出更多產(chǎn)品。

       四、總結(jié)

       燃石醫(yī)學(xué)的這款產(chǎn)品是2年前申報(bào)的，當(dāng)時(shí)NGS臨床數(shù)據(jù)不多，對(duì)NGS技術(shù)的認(rèn)可也不夠多，因此只涵蓋4個(gè)基因。隨著這2年間各個(gè)NGS基因檢測(cè)公司的崛起，大量各種用于科研和臨床的檢測(cè)項(xiàng)目的推出，已經(jīng)積累了足夠多的經(jīng)驗(yàn)和數(shù)據(jù)，因此預(yù)測(cè)下一步將會(huì)有NGS大panel(幾百甚至上千基因)的獲批。諾禾致源和其他NGS檢測(cè)公司也是如此，目前均已提前布局大panel產(chǎn)品的注冊(cè)申報(bào)工作，預(yù)測(cè)未來(lái)將推出更多產(chǎn)品。

       總體來(lái)說(shuō)，進(jìn)一個(gè)月以來(lái)的兩款NGS產(chǎn)品的獲批，使NGS檢測(cè)科研項(xiàng)目，通過(guò)國(guó)家層面的認(rèn)可和背書(shū)，逐漸像NIPT一樣，走向正規(guī)化。整個(gè)腫瘤基因檢測(cè)市場(chǎng)還處于市場(chǎng)培育期，接下來(lái)的2-3年內(nèi)，市場(chǎng)會(huì)爆發(fā)性的增長(zhǎng)。資本的助推，CFDA的認(rèn)證將會(huì)改變中國(guó)腫瘤基因檢測(cè)的現(xiàn)狀。進(jìn)而將會(huì)產(chǎn)生一系列的效應(yīng)，如行業(yè)洗牌，這勢(shì)必導(dǎo)致“有證”的活下來(lái)，不規(guī)范的被淘汰。在這數(shù)十億甚至是百億級(jí)別的市場(chǎng)，避諱群雄逐鹿，最后也將會(huì)是個(gè)位數(shù)的幾家公司分別占據(jù)不同地區(qū)或細(xì)分領(lǐng)域并存活下來(lái)。

       在這場(chǎng)激烈的競(jìng)爭(zhēng)中，不僅有國(guó)內(nèi)的眾多“英雄”，更有國(guó)際的眾多巨頭加入。其中羅氏已經(jīng)全資收購(gòu)Foundation Medicine，Illumina也投了很多NGS初創(chuàng)公司，賽默飛在醫(yī)院診斷領(lǐng)域的多年耕耘，三家肯定不會(huì)缺席中國(guó)市場(chǎng)的角逐。