今日,10x Genomics公司宣布收購位于瑞典斯德哥爾摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空間基因組學(xué)(spatial genomics)領(lǐng)域的領(lǐng)先公司。空間基因組學(xué)是一個(gè)新興領(lǐng)域,它不但讓研究人員可以獲得單細(xì)胞內(nèi)的基因組數(shù)據(jù),而且可以比較在組織不同部位的細(xì)胞中基因組信息的變化。這一技術(shù)在腫瘤學(xué)、神經(jīng)科學(xué)和免疫學(xué)等疾病領(lǐng)域中將有很廣泛的應(yīng)用前景,而且可用于更廣范圍的生物學(xué)研究。
Spatial Transcriptomics公司的宗旨是在細(xì)胞的形態(tài)學(xué)環(huán)境中理解基因表達(dá)對(duì)更深入地探索基因活性至關(guān)重要。該公司的技術(shù)平臺(tái)結(jié)合顯微成像技術(shù)和RNA測序技術(shù),能夠從一片完整的冰凍組織切片中,獲取切片上不同位置細(xì)胞中的完整轉(zhuǎn)錄組(transcriptome)數(shù)據(jù)。
該平臺(tái)的工作流程將冰凍組織切片覆蓋在特定的玻璃矩陣芯片上。芯片上固定著能夠捕獲細(xì)胞中mRNA的探針。探針上攜帶的條形碼標(biāo)志出它們在矩陣芯片上的位置。通過這種探針捕捉細(xì)胞中mRNA并進(jìn)行測序的方法,研究人員可以觀察到哪些基因在組織的特定位置表達(dá),并且可以定量檢測出它們的表達(dá)水平。
▲Spatial Transcriptomics公司技術(shù)平臺(tái)原理示意圖(圖片來源:參考資料[4])
“基因組學(xué)領(lǐng)域發(fā)展迅速,在很短的時(shí)間里我們已經(jīng)從對(duì)人類基因組測序進(jìn)步到對(duì)特定組織,甚至是單細(xì)胞進(jìn)行測序,” Spatial Transcriptomics公司聯(lián)合創(chuàng)始人Joakim Lundeberg教授說:“空間基因組學(xué)將是下一個(gè)發(fā)展前沿。我們很高興與10x Genomics公司合作,推廣這一技術(shù)的應(yīng)用”。
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