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抽管血,揪出癌癥“指紋”

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來源:中國科學(xué)報(bào)
  2019-01-07
該技術(shù)僅需抽取人體外周血,通過捕獲這些微量ctDNA中的甲基化位點(diǎn)改變,即可精確檢測到肝癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、肺癌等高發(fā)癌癥的早期信號。腫瘤在人體內(nèi)如同器官一樣,不斷地有細(xì)胞生長和死亡。而在腫瘤細(xì)胞壞死或凋亡過程中會釋放自身DNA并進(jìn)入血液循環(huán)。

       該技術(shù)僅需抽取人體外周血,通過捕獲這些微量ctDNA中的甲基化位點(diǎn)改變,即可精確檢測到肝癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、肺癌等高發(fā)癌癥的早期信號。

       腫瘤在人體內(nèi)如同器官一樣,不斷地有細(xì)胞生長和死亡。而在腫瘤細(xì)胞壞死或凋亡過程中會釋放自身DNA并進(jìn)入血液循環(huán)。這些在人體內(nèi)不斷流動(dòng)的腫瘤DNA碎片,就是循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA),也被形象地稱為癌癥“指紋”。

       近日,彭博社報(bào)道了一種可在腫瘤萌芽階段便能揪出這些“指紋”的IvyGene無創(chuàng)ctDNA甲基化液體活檢技術(shù),該技術(shù)僅需抽取人體外周血,通過捕獲這些微量ctDNA中的甲基化位點(diǎn)改變,即可精確檢測到肝癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌、肺癌等高發(fā)癌癥的早期信號。

       《中國科學(xué)報(bào)》了解到,該突破性技術(shù)是由美國加州大學(xué)圣地亞哥分校(UCSD)、中山大學(xué)腫瘤防治中心、西京醫(yī)院和華西醫(yī)院的科研團(tuán)隊(duì)共同研發(fā),研究成果已于2017年發(fā)表在Nature Materials(《自然—材料》)、PNAS(《美國科學(xué)院院刊》)等國際頂級期刊上。目前已由LAM(萊盟君泰)與中美科研團(tuán)隊(duì)共同合作,實(shí)現(xiàn)了技術(shù)的應(yīng)用轉(zhuǎn)化,在全球市場推出用于正?;蚋呶H巳旱姆喊┚珳?zhǔn)早篩及單癌種輔助診斷,給癌癥早期檢測帶來了曙光。

       前瞻性方向:ctDNA甲基化

       世界衛(wèi)生組織最新出爐的《2018全球癌癥年報(bào)》顯示,2018年全球預(yù)計(jì)有1810萬癌癥新發(fā)病例和960萬癌癥死亡病例。而在這龐大的新發(fā)癌癥病例中,亞洲占比高達(dá)50%;死亡癌癥病例中,亞洲占比更是高達(dá)70%。多種高發(fā)癌種的分布地圖上,中國均“榜上有名”。

       有效防控癌癥,早期檢測是關(guān)鍵。然而,目前常規(guī)的癌癥檢測手段(血清學(xué)腫瘤標(biāo)志物、影像檢查等)很難發(fā)現(xiàn)早期癌變,且誤診率較高,液體活檢技術(shù)正試圖打破了這一局限。

       “癌癥的形成是個(gè)長期的過程,在細(xì)胞剛剛發(fā)生癌變但卻還沒有形成癌灶之前,就會在體液中產(chǎn)生一些游離的‘破壞分子’。”南京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授朱海亮告訴《中國科學(xué)報(bào)》,液體活檢通過非侵入性取樣,如血液、唾液、尿液等,利用高通量測序技術(shù)、過濾、捕獲或富集體內(nèi)腫瘤細(xì)胞的基因組信息,從而把握住癌癥的蛛絲馬跡。

       朱海亮表示,液體活檢的四種主要腫瘤來源的生物標(biāo)志物分別是循環(huán)腫瘤細(xì)胞、ctDNA、外泌體和循環(huán)RNA。目前,臨床應(yīng)用廣泛集中在對ctDNA的研究上,因?yàn)閏tDNA能夠緊跟人體血液循環(huán)系統(tǒng)的DNA片段,側(cè)重基因?qū)用?,易于獲取突變信息,適用于早期診斷。

       “ctDNA攜帶腫瘤細(xì)胞突變或重組的基因。雖然只有整個(gè)DNA的不到1%,但由于其小于2小時(shí)的半衰期,更能反映腫瘤循環(huán)細(xì)胞中的準(zhǔn)確信息。”朱海亮補(bǔ)充道。

       為更好地將液體活檢應(yīng)用于癌癥早期檢測,萊盟君泰選擇了一個(gè)更具前瞻性的方向——ctDNA甲基化。該公司CEO顧桂國表示,腫瘤初期會發(fā)生腫瘤抑制基因甲基化水平升高或原癌基因甲基化降低的現(xiàn)象。因此,甲基化模式的改變被認(rèn)為是最先能檢測到的與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的惡化指標(biāo)。相較于傳統(tǒng)檢測和以ctDNA突變技術(shù)為主的中晚期腫瘤伴隨診斷,無創(chuàng)ctDNA甲基化液體活檢技術(shù)能夠更早、更精準(zhǔn)地發(fā)現(xiàn)腫瘤的存在。

       “DNA甲基化是一個(gè)開關(guān),正常的‘開與關(guān)’對生長發(fā)育、組織器官分化非常重要,異常的‘開與關(guān)’常常導(dǎo)致抑癌基因失活、原癌基因激活、染色體失穩(wěn)、基因突變及miRNA表達(dá)失調(diào),任何一方面異常都有可能導(dǎo)致腫瘤的發(fā)生。”此前在2018中國腫瘤學(xué)大會上,美國加州大學(xué)圣地亞哥分校教授張康解釋道,“不同甲基化位點(diǎn)對不同腫瘤具有特異性,肝癌、腸癌、胃癌的甲基化位點(diǎn)都不一樣,所以只要找到特異指紋,液體活檢就能夠找到不同癌癥特異性。”

       癌癥治療端口前移

       癌癥檢測最理想的方式就是,簡單抽取一管血,就能查出是否患癌,是哪種癌。但實(shí)現(xiàn)ctDNA的甲基化檢測技術(shù)門檻很高,一方面是ctDNA在血液中的含量極微(每毫升血中僅有約20ng ),且混雜在更大量的正常游離DNA 背景中,在如此微量的ctDNA中檢測單個(gè)堿基的甲基化水平存在很多困難。另一方面是每一種腫瘤都有復(fù)雜的甲基化模式,能夠覆蓋某個(gè)癌種所有腫瘤人群的位點(diǎn)勢必要用龐大的樣本數(shù)量去篩選,尋找這些與肝癌相關(guān)的甲基化位點(diǎn)就如同大海撈針。

       在這樣的挑戰(zhàn)下,UCSD、中山大學(xué)腫瘤防治中心等多個(gè)科研團(tuán)隊(duì)共同合作,完成超過3萬例血液樣本、48.5萬個(gè)全基因組甲基化位點(diǎn)及常見高發(fā)癌癥的深度機(jī)器學(xué)習(xí),篩選出針對腫瘤的靶向甲基化位點(diǎn),建立了高精準(zhǔn)的腫瘤篩查和預(yù)后模型。

       也正是這近50萬級的臨床樣本庫的積累,機(jī)器學(xué)習(xí)和醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)分析技術(shù)的發(fā)展,以及患癌高危人群對早期檢測的大量需求,加速了無創(chuàng)ctDNA甲基化腫瘤早期檢測技術(shù)從實(shí)驗(yàn)室技術(shù)到應(yīng)用技術(shù)的轉(zhuǎn)化。

       據(jù)張康介紹,目前他們不僅找到了肝癌指紋,還發(fā)現(xiàn)了肺癌指紋、乳腺癌指紋、結(jié)直腸癌指紋、胃癌指紋和胰 腺癌指紋等。

       萊盟君泰發(fā)布的肝癌早診最新臨床數(shù)據(jù)顯示,在保證肝癌檢測靈敏度95%的情況下,特異性達(dá)到97.5%;乳腺癌早診最新臨床數(shù)據(jù)顯示,在保證乳腺癌檢測靈敏度89%的情況下,特異性達(dá)到96%,進(jìn)一步驗(yàn)證了無創(chuàng)ctDNA甲基化液體活檢技術(shù)應(yīng)用于肝癌和乳腺癌檢測的高精準(zhǔn)度。

       “如果通過ctDNA甲基化液體活檢技術(shù),能夠把癌癥的檢測從中晚期提前到早期,那么大部分的患者完全可以通過手術(shù)治療,大幅提高5年生存率,降低癌癥的治療成本。” 萊盟君泰董事長李戍表示,隨著癌癥治療端口前移,癌癥將來就有可能成為一種慢性病。

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