科學(xué)家們發(fā)明了旨在控制細(xì)胞內(nèi)部運(yùn)作的工具---合成蛋白。與改編自大自然的生物技術(shù)工具不同的是,這種合成蛋白完全是由人類(lèi)構(gòu)想出來(lái)的,并且是在實(shí)驗(yàn)室中從頭開(kāi)始制造的少數(shù)蛋白之一。在兩項(xiàng)新的研究中,研究人員展示了這種工具如何被用來(lái)調(diào)整基因表達(dá),協(xié)調(diào)蛋白結(jié)合事件,以及根據(jù)環(huán)境變化提示細(xì)胞中發(fā)生的功能變化。相關(guān)研究結(jié)果于2019年7月24日在線(xiàn)發(fā)表在Nature期刊上,論文標(biāo)題為“Modular and tunable biological feedback control using a de novo protein switch”和“De novo design of bioactive protein switches”。
作為這兩篇論文的共同作者,Bobby Langan說(shuō)道,“細(xì)胞接受刺激信號(hào),隨后必須弄清楚針對(duì)此該做些什么。比如,它們使用自然系統(tǒng)來(lái)調(diào)節(jié)基因表達(dá)或降解蛋白。”這種新設(shè)計(jì)的工具稱(chēng)為L(zhǎng)OCKR(Latching, Orthogonal Cage/Key pRotein),通過(guò)在這些內(nèi)置系統(tǒng)的回路中引入生物活性肽來(lái)操縱它們。這些活性肽僅當(dāng)被特定的分子“鑰匙(keys)”釋放出來(lái)時(shí)才會(huì)暴露出來(lái)。
LOCKR由六個(gè)螺旋結(jié)構(gòu)組成,這六個(gè)螺旋結(jié)構(gòu)緊密結(jié)合而形成一個(gè)籠子。其中的一個(gè)螺旋結(jié)構(gòu)比其他的螺旋結(jié)構(gòu)更加松散地結(jié)合,并且可以被特定的分子—即前面提及的分子鑰匙---取代。當(dāng)這個(gè)分子鑰匙卡入到位時(shí),這個(gè)更加松散結(jié)合的螺旋結(jié)構(gòu)移動(dòng)到一邊,從而暴露出經(jīng)定制后執(zhí)行特定功能的生物活性肽。
在這兩項(xiàng)示范性研究中,這些研究人員使用LOCKR來(lái)觸發(fā)細(xì)胞死亡,降解特定蛋白,并指導(dǎo)物質(zhì)穿過(guò)活的細(xì)胞。單個(gè)LOCKR蛋白也可經(jīng)連接后形成回路,即細(xì)胞中能夠?qū)?nèi)部和外部刺激信號(hào)作出反應(yīng)而發(fā)生變化的系統(tǒng)。
這些研究人員首先在酵母中測(cè)試了他們的工具,隨后成功地設(shè)計(jì)出一種在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的人細(xì)胞中發(fā)揮作用的LOCKR修飾版本。
美國(guó)波士頓大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程師Ahmad Khalil(未參與這兩項(xiàng)研究)表示,“這表示著從頭設(shè)計(jì)蛋白的曙光。”從頭到尾由人類(lèi)設(shè)計(jì)的新蛋白,可能比用途發(fā)生改變的天然蛋白更具優(yōu)勢(shì)。
雖然天然存在的蛋白可以發(fā)揮多種功能并且通過(guò)不同的機(jī)制起作用,但是構(gòu)建出的合成蛋白僅做一件事。LOCKR是有史以來(lái)發(fā)明的首批從頭合成的蛋白之一,它僅能作為分子開(kāi)關(guān)發(fā)揮功能。
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