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CPHI制藥在線 資訊 漫談PCR技術與抗體藥物:站在巨人肩膀上的PCR

漫談PCR技術與抗體藥物:站在巨人肩膀上的PCR

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作者:1°C  來源:CPhI制藥在線
  2019-08-15
抗體藥物與PCR技術息息相關,在抗體藥物的早期發(fā)現(xiàn)中扮演著重要的角色,筆者借此機會分享一些PCR在抗體藥物發(fā)現(xiàn)中的應用。

       作為一個醫(yī)藥行業(yè)從業(yè)者,也許你對PCR再熟悉不過,但是,你可能無法清楚知道Kary Banks Mullis是哪位大神。

Kary Banks Mullis

       引用自 NobelPrize.org

       因一項技術而非重大的理論發(fā)現(xiàn)獲得諾貝爾獎,Kary Mullis的PCR技術應該是第1個,估計也不會有第2個出現(xiàn)!

       PCR已經(jīng)成為醫(yī)藥行業(yè)中一個極為普遍的技術,深刻影響了生命科學的發(fā)展,雖然技術僅僅出現(xiàn)30年,但是PCR已經(jīng)被廣泛應用于基因測序、分子診斷、遺傳學等等!

       事實上,抗體藥物同樣與PCR技術息息相關,在抗體藥物的早期發(fā)現(xiàn)中扮演著重要的角色,筆者借此機會分享一些PCR在抗體藥物發(fā)現(xiàn)中的應用。

       一.PCR是一個極為高效的DNA合成工廠

       雖然在抗體領域從業(yè)時間尚短,筆者對科學充滿著敬畏,深知一項改變世界的技術或是理論的價值,PCR在抗體藥物發(fā)現(xiàn)中的作用是十分關鍵的,與抗體的早期發(fā)現(xiàn)、基因工程、基因測序密切關聯(lián)!

       1. PCR與抗體發(fā)現(xiàn)

       從全球首個單抗藥物Muromonab上市以來,抗體藥物已經(jīng)被廣泛應用于各個疾病領域,幾十年來,抗體的發(fā)現(xiàn)技術也逐步成熟,這其中雜交瘤技術、噬菌體展示文庫、酵母展示文庫已成為抗體藥物發(fā)現(xiàn)的主要技術方法。例如,利用雜交瘤技術發(fā)現(xiàn)的各種-ximab,-zumab,利用噬菌體展示文庫發(fā)現(xiàn)的阿達木單抗,利用酵母展示文庫發(fā)現(xiàn)的信迪利單抗。

       1.1 PCR與雜交瘤技術

       雜交瘤技術是一個極為經(jīng)典的抗體發(fā)現(xiàn)方式,當然現(xiàn)在用于免疫的動物已經(jīng)從小鼠擴大到人源化小鼠、全人源小鼠、羊駝等。

       PCR在雜交瘤技術的用處主要在于免疫抗原的分子構(gòu)建,一般技術人員會讓基因合成公司合成特定抗原序列,然后,再將其構(gòu)建至in-house的表達載體。

       這是再熟悉不過的流程,但是,如果沒有PCR,你便會知道這是天方夜譚!

       1.2 PCR與抗體展示文庫

       抗體展示文庫也是抗體開發(fā)歷史上的一個巨大突破,這其中噬菌體展示文庫更是廣泛應用于抗體發(fā)現(xiàn),George P. Smith和Gregory P.Winter是該領域的先驅(qū),而PCR主要用于抗體展示文庫的構(gòu)建。

       Human-naïve 或 immune 抗體展示文庫中,PCR扮演重要角色:

       A. 從動物免疫細胞或是PBMC中提取tRNA,并利用PCR合成cDNA;

       B. 利用PCR擴增抗體的Vh, Vk/λ;

       C. scFv的分子構(gòu)建。

Schematic overview about the panning and screening procedure

       Schematic overview about the panning and screening procedure

       上圖參考來源為:《antibody engineering》

       阿達木單抗,全球首個全人員單克隆抗體,便是利用噬菌體展示文庫發(fā)現(xiàn)的。

       1.3 PCR與抗體人源化和親和力成熟

       上文提到,雜交瘤技術是抗體發(fā)現(xiàn)的經(jīng)典方法,但是鼠源抗體免疫原性和親和力是一個很大的問題,為了降低免疫原性,降低ADA,同時提高親和力,很多利用雜交瘤技術發(fā)現(xiàn)的單抗都要經(jīng)過人源化(humanization),以上事藥物中,凡是通用名-ximab,-zumab結(jié)尾的多是這種情況!

人源化

       圖片源自網(wǎng)絡https://www.biologicscorp.com/antibodyengineering.html/#.XVFVCG8zbOQ

       人源化和親和力成熟是一門大學問!無論是,CDR-grafting,定點突變或是抗體的定向進化,PCR均是在這里充當著基本的技術角色。

       2. PCR與抗體測序

       雜交瘤技術中,多輪亞克隆后,篩選到高親和力克隆,一定是需要對Vh, Vk/λ測序的,這個過程就是PCR的過程!

       total RNA→cDNA→Vh/Vk PCR→構(gòu)建至載體→測序

       3. PCR與雙特異性抗體

       雙特異性抗體不同于單克隆抗體,雙抗面臨許多工藝問題,盡量提高目標雙抗的產(chǎn)量,同樣盡量降低非目標雙抗的含量,這是雙抗的終極目的。

       但是,遠非這么簡單,雙抗的format是多種多樣的,有的看起來還極富想象力,有的很美,有的很丑,充滿腦洞,各種各樣format的分子構(gòu)建都要依賴PCR技術,例如,安進的BiTE, 羅氏的crossmab和knob-into-hole等等!

       PCR在抗體藥物中的應用絕不止以上幾個方面,細胞株的傳代穩(wěn)定性、細胞株構(gòu)建、常規(guī)的分子構(gòu)建和蛋白表達等,各種的花式PCR技術,巢式PCR,多重PCR,qPCR,熒光PCR,real-time PCR等等,充滿著想象力!

       二.漫談Kary Mullis

       PCR改變了世界,Kary Mullis的PCR技術也是站在偉人的肩膀上的一項發(fā)明!筆者看來,PCR技術得以出現(xiàn),它是建立在多個諾貝獎級別的關鍵突破上:

       1. DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的解析,Waston、Crick和Wilkins做出重要貢獻,諾貝爾獎1;

       2. 1957年,Arthur Kornberg發(fā)現(xiàn)第一種DNA聚合酶,開始正確認識DNA復制的分子過程,諾貝爾獎2;

       3. H.Gobind Khorana破解了所有密碼子,開創(chuàng)了許多寡核苷酸的合成技術,諾貝爾獎3;

       4. Khorana和他的學生Kleppe 發(fā)表一篇具有里程碑意義的文章Repair replications of short synthetic DNA's as catalyzed by DNA polymerases[1],這被廣泛認為是PCR雛形;

       5. 1976年,Jhon Trela和錢嘉韻成功從Thermus aquaticus內(nèi)提取到了能夠耐75℃以上高溫的TaqDNA聚合酶[2][3],這是極為重要的一個進展;

       6. 1987年,Kary Mullis關于PCR 的關鍵技術論文發(fā)表在Methods in Enzymology

       7. 1993年Kary Mullis獲諾貝爾獎

       正是上面1,2,3,5的關鍵理論和技術突破給PCR的出現(xiàn)奠定了良好的基礎,Kary Mullis是一個被選中的天才。

       從其自傳中,我們能夠?qū)ary Mullis有一個較為淺顯的認識,嚴重拖延癥、幻想癥、磕藥,筆者不對其三觀和行為持任何觀點,但是毫無疑問,他首先是一個天才,對,作為一個科學家,Kary Mullis科學知識扎實、思維活躍、極富想象力和洞察力,這是非常難得的科學品質(zhì)!

       參考來源:

       1. Kleppe K, Ohtsuka E, Kleppe R, Molineux I, Khorana HG "Studies on polynucleotides. XCVI. Repair replications of short synthetic DNA's as catalyzed by DNA polymerases." J. Molec. Biol. vol. 56, pp. 341-61 (1971).

       2. Brock TD, Freeze H "Thermus aquaticus, a Nonsporulating Extreme Thermophile" J. Bacteriol. vol. 98(1) pp. 289-297 (1969).

       3. Chien A, Edgar DB, Trela JM "Deoxyribonucleic acid polymerase from the extreme thermophile Thermus aquaticus" J. Bacteriol. vol. 174 pp. 1550-1557 (1976).

       4. Mullis KB and Faloona FA "Specific Synthesis of DNA in vitro via a Polymerase-Catalyzed Chain Reaction." Methods in Enzymology vol. 155(F) pp. 335-50 (1987).

       附:the PCR song

       作者簡介:1°C,醫(yī)藥行業(yè)從業(yè)人員,希望自己的專業(yè)文字會越來越有溫度,醫(yī)藥知識能夠服務更多人,打破信息知識的壁壘!

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