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CPHI制藥在線 資訊 數(shù)十家跨國(guó)藥企圍獵NTRK激酶抑制劑!誰(shuí)是王者

數(shù)十家跨國(guó)藥企圍獵NTRK激酶抑制劑!誰(shuí)是王者

熱門(mén)推薦: 癌癥 TRKA-C NTRK
來(lái)源:藥渡
  2020-11-02
NTRK融合,廣泛分布在不同類型的癌癥當(dāng)中,如涎腺乳腺樣分泌癌和先天性纖維肉瘤,可檢測(cè)到100%NTRK融合,且2018/2019兩款NTRK抑制劑的獲批,業(yè)界更是對(duì)該方向藥物的產(chǎn)出寄予了厚望,甚至一度被認(rèn)為是比肩于PD-1的小分子抗癌神藥。

       NTRK融合,廣泛分布在不同類型的癌癥當(dāng)中,如涎腺乳腺樣分泌癌和先天性纖維肉瘤,可檢測(cè)到100%NTRK融合,且2018/2019兩款NTRK抑制劑的獲批,業(yè)界更是對(duì)該方向藥物的產(chǎn)出寄予了厚望,甚至一度被認(rèn)為是比肩于PD-1的小分子抗癌神藥。筆者通過(guò)查詢,全球大型制藥公司已有數(shù)十家對(duì)該領(lǐng)域跑馬圈地,并從化合物結(jié)構(gòu)入手,總結(jié)如下。

       1、NTRK&TRKA-C簡(jiǎn)介

       NTRK,即神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子受體酪氨酸激酶(NeuroTrophin Receptor Kinase),由高度同源性的激酶TRK-A、TRK-B、TRK-C組成,屬于NTRK基因編碼。

       1982年,即從在兩個(gè)結(jié)腸癌患者中發(fā)現(xiàn)了高分子量DNA,從而進(jìn)一步鑒定出激酶TRK-A;盡管TRK最初在腫瘤轉(zhuǎn)化中被確定,但是該家族普遍分布在神經(jīng)系統(tǒng)中,并且與神經(jīng)發(fā)育高度相關(guān);而TRK系列也是由NTRK1、NTRK2和NTRK3編碼為T(mén)RK-A,TRK-B和TRK-C。

       2、已上市代表藥物

       1)首個(gè)上市藥物-拉羅替尼(larotrectinib)

       最初,Janne和Doebele等報(bào)道發(fā)現(xiàn)了larotrectinib,一種泛NTRK抑制劑,其IC50值在2-20 nM之間,對(duì)其他激酶具有良好的選擇性(IC50> 1 mM)。該品種美中不足的是,患者耐藥后療效持續(xù)時(shí)間大大降低。Larotrectinib于2018年獲FDA批準(zhǔn)(商品名稱:Vitrakvi),用于治療患有NTRK基因融合而非特定癌癥類型的實(shí)體瘤的成年和小兒患者。

       2)第2個(gè)上市藥物-恩曲替尼(Entrectinib)

       恩曲替尼,可靶向TRKs、蛋白激酶ROS和激酶Alk,具有抑制多種癌癥適應(yīng)癥的活性。對(duì)TRKA-C的IC50 <10 nM。研究發(fā)現(xiàn)恩曲替尼對(duì)3種不同類型的癌細(xì)胞具有抑制活性:TRKA驅(qū)動(dòng)的細(xì)胞系(KM12,IC50-17 nM),Alk依賴性細(xì)胞系(SU-DHL-1,IC50-20 nM)和依賴Flt3的AML細(xì)胞系(MV-4-11 ,IC50-81 nM)。PS:與拉羅替尼結(jié)構(gòu)對(duì)比,仍為3部分組成,但已存在顯著的不同之處。

       3)LOXO-195(II期)-克服耐藥

       為克服拉羅替尼的耐藥問(wèn)題,Rothenberg和Hyman等人,報(bào)道發(fā)現(xiàn)了LOXO-195?;钚苑矫?,LOXO-195與拉羅替尼相似,但拉羅替尼對(duì)突變的TRKA的抑制作用大大降低,而LOXO-195對(duì)該突變的IC50仍可到2-9 nM;該品種目前處于II期階段。

       PS:將鏈狀結(jié)構(gòu)修飾為大環(huán),已是常用手段,國(guó)內(nèi)外對(duì)此仍樂(lè)此不疲...

       3、跑馬圈地-數(shù)十家跨國(guó)公司圍獵NTRK

       當(dāng)前TRK抑制劑的開(kāi)發(fā)方向可大致分為“ATP競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑”、“非ATP競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑”兩大類,其中以“ATP競(jìng)爭(zhēng)性抑制劑”為主,這也是大多數(shù)制藥公司的圍攻熱點(diǎn)。

       經(jīng)查詢,有近20家大型制藥公司對(duì)該領(lǐng)域進(jìn)行了專利布局跑馬圈地,篇幅原因,在此進(jìn)一步挑選出具有代表性的制藥公司(如阿斯利康、默沙東,及我國(guó)的正大天晴等)所布局的專利及代表化合物,以總覽TRK抑制劑的全球布局狀態(tài)。

       1)阿斯利康-專利群圍攻NTRK

       阿斯利康,自2005年以來(lái)已申請(qǐng)了如下圖所示的多個(gè)專利;并從中篩選出的N-嘧啶-1H-吡唑-3-胺結(jié)構(gòu),被最先定為T(mén)RK抑制劑的母核開(kāi)發(fā)方向。PS:至今,阿斯利康已有多個(gè)化合物進(jìn)入到臨床不同階段。

       后發(fā)現(xiàn),將嘧啶替換為取代的苯環(huán)會(huì)降低其對(duì)TRKs的抑制作用,后繼續(xù)嘗試將嘧啶環(huán)替換為吡啶環(huán),以及研究N在吡啶環(huán)中的位置,發(fā)現(xiàn)其活性趨勢(shì)如下圖所示。

       進(jìn)一步,在專利WO2007049041中,將5-氟哌啶進(jìn)一步引入上述結(jié)構(gòu)中可大大增強(qiáng)對(duì)TRKs的抑制作用。此外,該化合物對(duì)JAK2的IC50值為3.9 nM。

       2)默沙東-同樣申請(qǐng)了眾多專利

       默沙東,專利WO2015042085保護(hù)了一系列對(duì)TRKA具有強(qiáng)抑制能力的聯(lián)芳基脲衍生物;其要求的保護(hù)的實(shí)施例化合物IC50近50nM。

       又一項(xiàng)專利中,保護(hù)了脲鏈接的芳基-芴結(jié)構(gòu),對(duì)TRKA的IC50值約為30 nM。

       另一項(xiàng)專利,刪除了脲結(jié)構(gòu)中的氮原子,以酰胺的方式鏈接兩個(gè)芳環(huán);該系列代表化合物對(duì)TRKA的抑制可達(dá)1 nM水平。

       再一項(xiàng)專利中,開(kāi)發(fā)了一個(gè)相似的核心骨架-吡唑并[4,3-b]吡啶,同樣,該系列化合物還顯示出高效的TRKA抑制能力。

       3)輝瑞-WO2015159175/WO2015170218

       輝瑞,專利保護(hù)了一類稠環(huán)化合物,以N-苯基吡唑環(huán)作為核心骨架,3-位引入酰胺結(jié)構(gòu);該系列代表化合物的IC50值可以達(dá)到2 nM。

       另一專利WO2015170218,保護(hù)了一系列芳基取代的3-酰胺吡唑衍生物;同樣對(duì)TRKA存在較好的活性數(shù)據(jù)。

       4)百時(shí)美施貴寶- WO2007061882

       Bristol-Myers Squibb,專利保護(hù)了一系列吡咯并三嗪衍生物,該系列化合物對(duì)TRKA/B的IC50值最?。? nM。

       5)雷迪博士- US20150368238

       雷迪博士實(shí)驗(yàn)室,專利保護(hù)了一系列咪唑并[1,2-a]吡啶衍生物,該系列化合物對(duì)TRKA的抑制活性可達(dá)<50 nM。PS:結(jié)構(gòu)與拉羅替尼很接近。

       6)正大天晴-WO2018022911

       中國(guó)正大天晴制藥集團(tuán)有限公司,申請(qǐng)專利保護(hù)一系列吡唑并[1,5-a]嘧啶衍生物;在這一系列化合物中,LOXO-101中的脲基被酰胺基取代;且存在伯胺。該系列化合物具有泛TRK抑制能力,對(duì)TRKA-C的IC50值<10 nM,而JAK2不受影響;于國(guó)內(nèi)而言,值得關(guān)注。

       7)TP therapeutics-WO2018077246

       TP therapeutics公司專利保護(hù)了一系列大環(huán)化合物,與LOXO-195相比,最大的不同是芳基和吡唑并[1,5-a]嘧啶二胺基之間的引入了一個(gè)氧原子;同時(shí),該系列化合物顯示出對(duì)TRKA的高選擇性。

       8)Array Biopharma Inc-WO2015175788

       Array Biopharma Inc,專利保護(hù)了一系列芳基脲衍生物,這些衍生物對(duì)TRKA同樣具有良好的抑制能力及選擇性。PS:這類化合物仍以3部分組成,脲結(jié)構(gòu)被保留。

       9)鹽野義-WO2017135399

       鹽野義,專利保護(hù)了一系列的四氫吡咯取代的脲衍生物,該系列代表化合物也可達(dá)到<50 nM的IC50值。

       又一化合物專利,提出了一系列3環(huán)稠合脲衍生物;同樣該系列化合物對(duì)TRKA也存在較高的抑制活性。

       10)藍(lán)圖藥物-WO2017087778/US20160168156

       藍(lán)圖藥物,專利保護(hù)了一系列吡唑并[1,5-a]嘧啶衍生物,其實(shí)施例代表化合物除活性IC50值<10nM,同時(shí)對(duì)G595R-KM12細(xì)胞系中的TRK具有較好的抑制作用。

       2017年,藍(lán)圖還申請(qǐng)了一系列吡唑并[3,4-d]嘧啶衍生物,代表化合物的IC50值<10 nM。

       4、小結(jié)

       綜上結(jié)構(gòu)不難發(fā)現(xiàn),當(dāng)前大多數(shù)制藥公司開(kāi)發(fā)的NTRK抑制劑主要由3部分構(gòu)成,以拉羅替尼為參照的較多;同時(shí),也有部分公司開(kāi)發(fā)的結(jié)構(gòu),成功完成了骨架躍遷。但,如此多的高活性化合物,真正進(jìn)入到臨床的并不多。筆者將在后續(xù)的文章中,繼續(xù)對(duì)該熱門(mén)方向藥物進(jìn)行梳理,會(huì)著重研究那些未進(jìn)入臨床“失敗”的化合物,以了解是何種原因降低了他們的成藥性!

       參考資料:

       1. European Journal of Medicinal Chemistry.https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.04.053

       2. Nature Reviews | Clinical Oncology.https://doi.org/10.1038/s41571-018-0113-0

       3. SCIFINDER

       4. www.drugfuture.com

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