IDH靶點概述
異檸檬酸脫氫酶(Isocitrate dehydrogenase,IDH)是人體內(nèi)三羧酸循環(huán)中細(xì)胞呼吸所需的關(guān)鍵酶,有IDH1,IDH2和IDH3三種異構(gòu)酶形式,其中IDH1和IDH2突變與腫瘤的發(fā)生和發(fā)展有密切的關(guān)系,但I(xiàn)DH3突變并不常見,結(jié)構(gòu)上,IDH1和IDH2是結(jié)構(gòu)高度相似的同工異構(gòu)酶,其在細(xì)胞內(nèi)均以同源二聚體的形式存在,同源二聚體的每個亞基均有一個活性中心,而IDH3是一個異源四聚體結(jié)構(gòu)。
IDH靶點與腫瘤的關(guān)系
IDH1和IDH2兩個基因的熱點突變最早由閻海教授及其合作伙伴在成人膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(一種惡性腦腫瘤)患者中發(fā)現(xiàn),該成果分別刊登于Science和NEJM,從此讓IDH進(jìn)入了癌癥基因組學(xué)科學(xué)家們的視野。在此后的研究報道中,IDH1/2基因突變的臨床意義逐漸在包括急性髓細(xì)胞性白血病(AML)、肝內(nèi)膽管癌、軟骨肉瘤、甲狀腺癌、前列腺癌、副神經(jīng)節(jié)瘤以及黑色素瘤等在內(nèi)的眾多癌癥中被發(fā)現(xiàn)。2016年IDH1/2被寫入《WHO中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤分類》指南,這是人類歷史上第一次將分子分型作為腦腫瘤診斷的金標(biāo)準(zhǔn)。IDH1/2 突變對應(yīng) WHO 分型有一定的分布規(guī)律,主要分布在 II~III 級少突膠質(zhì)瘤(69.2%)、星形細(xì)胞瘤 (79.8%)、少突星形細(xì)胞瘤(75.5%) 和 IV 級繼發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(>50%)中, 而在原發(fā)性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤(<5%)和兒童膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中卻少見。2018年,閻海教授帶領(lǐng)團(tuán)隊首次通過全基因組測序繪制了TERTpwt-IDHwt的基因譜,成果發(fā)表于《Nature》子刊,基于此,惡性腦腫瘤的分子分型標(biāo)準(zhǔn)或有望得以進(jìn)一步更新。
在血癌研究領(lǐng)域,在大多數(shù)成人AML研究中,IDH1的突變頻率約為5.5%-10.4%,而IDH2突變頻率約為8.6%-17.7%。針對IDH突變的靶向治療在AML中的潛在效果已在多項體外及體內(nèi)的臨床前研究中得到證實。2017年8月,F(xiàn)DA批準(zhǔn)了新基和Agios的IDH2抑制劑enasidenib (商品名Idhifa,曾用名AG-221),用于治療IDH2變異、復(fù)發(fā)難治型AML,同時批準(zhǔn)了雅培的RealTime IDH2檢驗試劑盒作為伴隨診斷。
突變體生成的新酶mutIDH1/2,可以將原來野生型IDH1/2的產(chǎn)物α-酮戊二酸(αKG)在胞漿/線粒體中轉(zhuǎn)化為致癌代謝物2-羥基戊二酸(2HG)。2HG能夠胞漿/細(xì)胞核中競爭性地抑制α-酮戊二酸依賴的二氧酶。2HG介導(dǎo)的10-11易位(TET)酶和組蛋白賴氨酸脫甲基酶(KDM)活性抑制分別導(dǎo)致了全細(xì)胞對于DNA和組蛋白的表觀遺傳學(xué)修飾,進(jìn)而導(dǎo)致了過甲基化表型。對丙酰羥化酶和賴氨酸羥化酶(例如PLOD1-3)的抑制能夠干擾膠原的成熟以及缺氧誘導(dǎo)因子1α(HIF-1α)的降解途徑,從而能夠在翻譯后對HIF-1α進(jìn)行穩(wěn)定。此外,負(fù)責(zé)修復(fù)DNA氧化損傷的ALKBH,也會收到2HG的抑制。
IDH全球臨床試驗開展情況
IDH抑制劑通過作用于腫瘤細(xì)胞中的IDH突變位點,使體內(nèi)致癌代謝物2HG減少,從而誘導(dǎo)組蛋白去甲基化,達(dá)到抑制腫瘤發(fā)展的效果。IDH抑制劑根據(jù)作用靶點分為IDH1抑制劑、IDH2抑制劑和IDH1/IDH2抑制劑三種。
對于IDH2突變的AML靶向治療研究早在2013年就已經(jīng)開展,其主要作用靶點是IDH2R140Q,候選藥物為AG-221 (enasidenib)。該藥物最早由Agios Pharmaceuticals公司研發(fā),命名為AGI-6780,在臨床1/2其實驗中,100mg/天給藥量的總反應(yīng)率為38.5%(42/109),完全緩解率為20.2(22/109)。給藥結(jié)果導(dǎo)致了D2HG水平的有效抑制。同樣來源自Agios制藥公司的AGI-5198,又稱為AG-120(ivosidenib),能夠降低膠質(zhì)瘤細(xì)胞內(nèi)的D2HG的水平,促進(jìn)組蛋白去甲基化,從而抑制IDH1突變的膠質(zhì)瘤細(xì)胞。該藥物于2014年開始進(jìn)行臨床試驗,對AML患者的完全緩解率為30.4%,效果可持續(xù)8.2個月。
截止到2020年11月20日,涉及IDH的臨床試驗有112項。主要分布于北美、歐盟和中國。其中涉及IDH1基因突變的有46項,IDH2基因突變的有32項。
美國已獲批IDH伴隨診斷試劑盒
2017年8月1日,F(xiàn)DA批準(zhǔn)Idhifa (enasidenib,Celgene Corp.)用于對攜帶有特定基因突變的復(fù)發(fā)或難治性急性髓系白血病(AML)成人患者進(jìn)行治療。與此同時,該藥物也被批準(zhǔn)與能夠檢測AML患者IDH2基因突變的RealTime IDH2伴隨診斷試劑盒同時使用。如果能夠在患者的血液或者骨髓中檢測到IDH2突變,這些患者就是被推薦使用Idhifa進(jìn)行治療的適宜人群。
2018年7月20日,F(xiàn)DA批準(zhǔn) Tibsovo (ivosidenib, Agios Pharmaceuticals, Inc.) 用于對可能攜帶IDH1突變的復(fù)發(fā)或難治性急性髓系白血病(AML)成人患者進(jìn)行治療。與之匹配的伴隨診斷試劑是同日獲批的Abbott RealTime IDH1 Assay。
2019年5月2日,F(xiàn)DA又進(jìn)一步批準(zhǔn)了Tibsovo (ivosidenib, Agios Pharmaceuticals, Inc.) 用于治療至少75歲或其共患病排除使用強(qiáng)化誘導(dǎo)化療方法進(jìn)行治療、新診斷出可能攜帶IDH1突變的復(fù)發(fā)或難治性急性髓系白血病(AML)患者。
以上所配套的伴隨診斷試劑都是Abbott公司的產(chǎn)品,分別為Abbott RealTime IDH2 Assay和Abbott RealTime IDH1 Assay。Abbott RealTime IDH2 Assay是一款可在Abbott m2000rt 系統(tǒng)上運行的PCR產(chǎn)品,可用于對編碼IDH2的9種單核苷酸突變(SNVs)進(jìn)行定性檢測((R140Q, R140L, R140G, R140W, R172K, R172M, R172G, R172S和R172W),待測DNA可提取自血液(EDTA)或骨髓(EDTA)。Abbott RealTime IDH1 Assay的區(qū)別在于其能夠檢測編碼IDH1 R132的5種單核苷酸突變(SNVs)((R132C, R132H, R132G, R132S和R132L)。
泛生子在IDH的解決方案
國內(nèi)首款NMPA獲批IDH試劑盒(PCR法)
2018年,NMPA批準(zhǔn)了泛生子的人IDH1基因突變檢測試劑盒(PCR-熒光探針法)(國械注準(zhǔn)20173401602)用于定性檢測膠質(zhì)瘤患者的中性甲醛固定、石蠟包埋的膠質(zhì)瘤組織樣本的IDH1(異檸檬酸脫氫酶1)基因突變(R132HCGT>CAT)。此Aassy是國內(nèi)首款獲批適應(yīng)癥為膠質(zhì)瘤的IDH檢測試劑盒,該試劑盒不僅是泛生子將科研技術(shù)進(jìn)行臨床轉(zhuǎn)化的一項重要成果,也是泛生子深入推進(jìn)“服務(wù)+產(chǎn)品”模式的重要體現(xiàn),其獲批為臨床的膠質(zhì)瘤病理分型提供了重要指導(dǎo)和參考。
IDH1基因檢測試劑盒采用ARMS-qPCR(突變阻滯擴(kuò)增系統(tǒng)-聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù),基于實時熒光PCR平臺,結(jié)合特異性引物和Taqman探針(熒光標(biāo)記探針)兩種技術(shù)。該試劑盒的主要優(yōu)勢體現(xiàn)如下
1、靈敏度高
可以檢測到10ng/μL DNA樣品中低至1%的基因突變。
2、操作便利
熒光定量PCR操作方法標(biāo)準(zhǔn)化,一次上機(jī)可檢測多達(dá)90個樣品,檢測時間約為1個小時。全封閉體系,減少污染的可能性。
3、結(jié)果判讀簡便
檢測結(jié)果客觀數(shù)據(jù)化,無需肉眼主觀性判定,簡便易行。
基于NGS平臺的拓展解決方案
以Agios和Celgene公司開發(fā)的Vorasidenib為例,我們可以注意到新的IDH抑制劑已經(jīng)在朝著多靶點、多適應(yīng)癥的趨勢發(fā)展。能夠同時檢測IDH1和IDH2,甚至包括更多其他潛在靶點的需求也應(yīng)運而生,而以高通量、準(zhǔn)確、快速為優(yōu)勢點的NGS技術(shù)能夠很好的滿足這一場景的需求,泛生子目前面向臨床端推廣的多款NGS panel均涵蓋IDH1/2靶點及腫瘤信號通路相關(guān)重要基因,可用于提供實體瘤、血液腫瘤分型、預(yù)后、用藥等多維指導(dǎo)。
IDH靶點伴隨診斷注冊策略及建議
近些年 ,國內(nèi)外各大藥廠在IDH管線上的頻頻出手,也促使IDH1/2成為伴隨診斷的熱門靶點。此前FDA批準(zhǔn)的兩款雅培IDH1/2伴隨診斷試劑,采用的是與藥物同步開發(fā)和同步獲批的形式,其中對于藥效相關(guān)性的研究,以IDH2為例,雅培的伴隨診斷試劑與藥物IDHIFA同步開展了臨床試驗AG221-C-001,通過前瞻性地對受試者IDH突變狀態(tài)進(jìn)行篩選入組,或回顧性地對其他檢測入組樣本進(jìn)行確認(rèn),評價了199例IDH2突變患者在接受100mg/天劑量IDHIFA治療后完全緩解(CR)人數(shù)所占的比例,最終證實了患者獲益。
從上述獲批案例中,我們不難看到要驗證一款I(lǐng)DH伴隨診斷試劑所要完成的工作,既包含全面的分析性能驗證,涉及的內(nèi)容可能包括最低檢出線(LOD)、樣本起始量、交叉反應(yīng)、內(nèi)/外源干擾物質(zhì)、精密度、重現(xiàn)性,以及其他金標(biāo)準(zhǔn)或公認(rèn)方法的相互比較等系列試驗,又包含藥物療效的關(guān)聯(lián)研究。前者需要IVD生產(chǎn)企業(yè)能夠?qū)Π殡S診斷產(chǎn)品的檢測性能擁有深后的研發(fā)與改進(jìn)能力,后者則要求IVD生產(chǎn)企業(yè)擁有更多的行業(yè)運營綜合能力,包括與外部制藥企業(yè)的合作、在各種臨床場景(包括真實世界數(shù)據(jù))下驗證伴隨診斷產(chǎn)品臨床有效性,最終才能夠獲得藥監(jiān)部門的批準(zhǔn)。泛生子目前針對IDH1/2靶點已具備完善的多平臺解決方案,我們愿同藥企合作伙伴一起努力,共同加速推進(jìn)靶向IDH藥物的臨床試驗進(jìn)展,早日為廣大患者迎來用藥治療及獲益機(jī)會!
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