記者 |金淼
編輯 |許悅
更具傳播能力的冠狀病毒變異毒株正在席卷全球,科學(xué)家們正爭(zhēng)分奪秒的了解為什么這些變異毒株傳播更快,以及對(duì)于**和檢測(cè)試劑來(lái)講,這些變異會(huì)造成哪些影響。
目前來(lái)看,英國(guó)和南非發(fā)現(xiàn)的新型冠狀病毒變異毒株似乎更易傳播,而**和治療手段對(duì)于南非變異毒株可能不太有效。
除了使現(xiàn)有的**和治療手段都面臨有效性的考驗(yàn)外,新冠變異毒株也可能降低新冠檢測(cè)試劑的有效性。
此前世界衛(wèi)生組織對(duì)于變異新冠病毒可能使得新冠檢測(cè)試劑失效問(wèn)題表示,變異病毒中出現(xiàn)的69-70del缺失,可能會(huì)讓部分使用S基因靶標(biāo)的檢測(cè)試劑受到影響。
刺突狀的S蛋白是新冠病毒最重要的表面膜蛋白,決定新冠病毒的宿主范圍和特異性。
絕大多數(shù)的診斷試劑還未受到影響,在246個(gè)FDA授權(quán)的檢測(cè)中,有85%的檢測(cè)試劑不依賴(lài)S基因,而是通過(guò)尋找N基因。約翰斯霍普金斯健康安全中心的免疫學(xué)家Gigi Kwik Gronvall在接受華爾街日?qǐng)?bào)采訪(fǎng)時(shí)表示,大多數(shù)檢測(cè)試劑仍然沒(méi)有問(wèn)題,因?yàn)檫@些檢測(cè)試劑的靶標(biāo)并非S基因。
但包括賽默飛世爾生產(chǎn)的少部分試劑產(chǎn)品受到影響。
賽默飛世爾表示,其一款產(chǎn)品在去年9月和10月間收到了來(lái)自英國(guó)的報(bào)告,表明無(wú)法找到英國(guó)變異毒株。去年12月,該公司又收到來(lái)自美國(guó)的相同報(bào)告。據(jù)此,賽默飛已經(jīng)開(kāi)發(fā)了更新軟件,幫助實(shí)驗(yàn)室去標(biāo)記這部分,并且開(kāi)發(fā)了新的測(cè)試產(chǎn)品,能夠識(shí)別與關(guān)鍵變異相關(guān)的病毒突變。
世界衛(wèi)生組織曾建議使用針對(duì)S基因檢測(cè)產(chǎn)品,可同時(shí)平行使用針對(duì)不同病毒基因的多靶標(biāo)檢測(cè),以減少對(duì)檢測(cè)準(zhǔn)確性的影響。
許多試劑制造企業(yè)也在通過(guò)增加靶標(biāo),以使得檢測(cè)更加有效,比如賽默飛世爾的TaqPath組合試劑盒則通過(guò)搜尋S基因在內(nèi)的三個(gè)靶標(biāo)來(lái)實(shí)現(xiàn)檢測(cè),而即使其中S靶標(biāo)因英國(guó)變種導(dǎo)致缺失,其他兩個(gè)靶標(biāo)也能夠幫助檢測(cè)完成檢測(cè)。
鹽湖城奧雅納實(shí)驗(yàn)室臨床微生物學(xué)主任 Kimberly Hanson在此前一次媒體溝通中表示,在檢測(cè)時(shí),三個(gè)靶標(biāo)中的兩個(gè)出結(jié)果,就可以稱(chēng)之為陽(yáng)性檢測(cè)了。
2月8日,猶他州的ARUP實(shí)驗(yàn)室通過(guò)篩選7.7萬(wàn)份賽默飛世爾的檢測(cè)結(jié)果發(fā)現(xiàn)大約有400例檢測(cè)中S蛋白項(xiàng)缺失,賽默飛對(duì)其中150個(gè)樣本進(jìn)行了全基因組測(cè)序,發(fā)現(xiàn)了其中4例系出現(xiàn)了英國(guó)新冠變異毒株。
雖然S基因的失效,但是其對(duì)于病毒的區(qū)分也有重要意義。
而一旦出現(xiàn)S基因缺失的情況則也會(huì)反映病毒的變異及傳播速度,目前基因測(cè)序公司Helix正在對(duì)加州和佛羅里達(dá)州的檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行跟蹤,以發(fā)現(xiàn)變異情況。
拜登政府也于本周內(nèi)表示,疾控中心將投資約2億元,擴(kuò)大病毒基因測(cè)序規(guī)模,以追蹤新出現(xiàn)的變異。
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