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CPHI制藥在線 資訊 50億美元背后 如何開發(fā)出更好的CDK抑制劑?

50億美元背后 如何開發(fā)出更好的CDK抑制劑?

熱門推薦: Palbociclib 腫瘤 CDK
來源:新浪醫(yī)藥新聞
  2021-05-17
持續(xù)的增殖是腫瘤細(xì)胞的一個(gè)重要特征,因此阻滯腫瘤細(xì)胞周期,便成為了控制腫瘤發(fā)展的重要手段。細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(CDK),作為參與細(xì)胞周期調(diào)節(jié)的關(guān)鍵激酶,圍繞該家族的抑制劑開發(fā),已成為近年來腫瘤領(lǐng)域藥物開發(fā)的重要分支。

       持續(xù)的增殖是腫瘤細(xì)胞的一個(gè)重要特征,因此阻滯腫瘤細(xì)胞周期,便成為了控制腫瘤發(fā)展的重要手段。細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶(CDK),作為參與細(xì)胞周期調(diào)節(jié)的關(guān)鍵激酶,圍繞該家族的抑制劑開發(fā),已成為近年來腫瘤領(lǐng)域藥物開發(fā)的重要分支,如較為成熟的CDK4/6抑制劑Palbociclib——2020年全球銷量就已>50億美元。那么,圍繞整個(gè)CDK家族抑制劑的開發(fā),自然成為了藥物研發(fā)的大熱門。本文將綜述CDK抑制劑的最新藥物開發(fā)進(jìn)展。

       01  CDK家族簡介

       CDK,屬于絲/蘇氨酸蛋白激酶家族,目前已報(bào)道有20個(gè)不同的家族亞型,均含有一段PSTAIRE的同源序列,并通過該序列與相應(yīng)的調(diào)節(jié)亞基-細(xì)胞周期蛋白(cyclin)結(jié)合形成有活性的異源二聚體,參與轉(zhuǎn)錄、代謝、神經(jīng)分化和發(fā)育等生理過程。

       依據(jù)功能分類:

       一類CDK參與細(xì)胞周期調(diào)控,主要包括CDK1、CDK2、CDK4、CDK6等;

       一類CDK參與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié),主要包括CDK7、CDK8、CDK9、CDK10、CDK11等。

       在腫瘤細(xì)胞中,cyclin過表達(dá)或過度活化、CDKI活性被抑制、上游分裂信號(hào)持續(xù)激活等都會(huì)引起CDK的活性改變,參與腫瘤的發(fā)生發(fā)展。由于CDK活性為細(xì)胞分裂所必需,而在腫瘤細(xì)胞中又常有CDK活性增強(qiáng),因此長期以來,CDK一直被認(rèn)為是抗腫瘤及其他增殖失調(diào)疾病藥物研發(fā)的較好靶點(diǎn)。當(dāng)前,已獲批上市的CDK抑制劑主要為CDK4/6抑制劑,其他亞型已有眾多進(jìn)入到臨床開發(fā)。

       02  CDK家族抑制劑開發(fā)策略

       過去的10年,CDK抑制劑的開發(fā)取得了巨大的進(jìn)展。該領(lǐng)域藥物的發(fā)現(xiàn),除了可逆ATP競爭/非競爭抑制劑,還發(fā)展了共價(jià)結(jié)合形式的不可逆ATP競爭抑制劑、可逆/不可逆的變構(gòu)抑制劑、CDK降解等多種途徑的藥物開發(fā),為該領(lǐng)域的藥物發(fā)現(xiàn)提供了眾多進(jìn)展性的思路。

       最早開發(fā)的CDK抑制劑為泛CDK抑制劑,如flavopiridol、seliciclib。但由于多靶點(diǎn)活性導(dǎo)致了療效和安全性存在了矛盾,從而大大限制了臨床開發(fā),后也因此逐漸發(fā)展為更具選擇性的抑制劑,如milciclib、dinaciclib、CYC-065、AT751978。

       標(biāo)準(zhǔn)ATP口袋外部半胱氨酸和賴氨酸殘基的存在,將研究者的注意力轉(zhuǎn)移到了共價(jià)抑制劑的開發(fā),2017年首 個(gè)CDK共價(jià)抑制劑SY-136585進(jìn)入了臨床研究。而對(duì)于非競爭性ATP抑制劑,雖有部分報(bào)道,但該領(lǐng)域的進(jìn)展相對(duì)還是緩慢。另一類藥物,擬肽類近年來略開始發(fā)力,如MM-D37K已進(jìn)入臨床試驗(yàn),關(guān)注度相對(duì)較高。再一類就是CDK靶向蛋白降解,如近年來逐漸被驗(yàn)證的PROTAC或ADC藥物,也正在逐漸顯示優(yōu)勢(shì),如針對(duì)CDK11開發(fā)的的ADC。

       03  變構(gòu)&共價(jià)&降解&可逆

       ☆ 變構(gòu)抑制劑

       當(dāng)前主要還是處于臨床前階段。通常,在充滿ATP競爭性可逆或不可逆抑制劑的領(lǐng)域中,需要提高藥效來提升品種競爭力;很少有通過CDK的靶向變構(gòu)位點(diǎn)來進(jìn)行上述提效工作。acrylamide-1,可以共價(jià)變構(gòu)鍵合野生型CDK2的半胱氨酸位點(diǎn),但不能作用突變型CDK2(Cys177A);且晶體學(xué)證明acrylamide-1共價(jià)于半胱氨酸177,而配體結(jié)合到與CDK結(jié)合界面相鄰的淺口袋中,與色氨酸和蛋氨酸相互作用。

       ☆ 共價(jià)抑制劑

       共價(jià)結(jié)合的CDK抑制劑,絕 對(duì)為近年來開發(fā)的熱點(diǎn),通??蓪?shí)現(xiàn)更高的活性和選擇性,從而導(dǎo)致更持久的治療效果,并可能減輕嚴(yán)重的副作用。2014年,THZ1被開發(fā)為CDK家族的第1個(gè)共價(jià)抑制劑,其具有CDK7/12/13的抑制效果,在體外和體內(nèi)均抑制了依賴于致癌SEs的腫瘤類型,例如骨肉瘤,食道鱗狀細(xì)胞癌,成人T細(xì)胞白血病,MYCN擴(kuò)增型神經(jīng)母細(xì)胞瘤,黑色素瘤或小細(xì)胞肺癌;當(dāng)然,作用位點(diǎn)仍然為丙烯酰胺與半胱氨酸。通過進(jìn)一步的SAR優(yōu)化,得到了化合物THZ531,也由此顯著提升了對(duì)CDK12/13的活性和選擇性。

       ☆ 靶向降解

       通過增強(qiáng)CDK蛋白的泛素化作用,誘導(dǎo)其介導(dǎo)的蛋白酶體產(chǎn)生降解作用,從而抑制蛋白功能。哺乳動(dòng)物體內(nèi)細(xì)胞,許多蛋白質(zhì)的降解是通過泛素-蛋白酶體系統(tǒng)來進(jìn)行,泛素通過共價(jià)于目標(biāo)蛋白質(zhì)的賴氨酸殘基上發(fā)揮降解作用。PROTAC技術(shù)近些年的成熟,更是進(jìn)一步催化了這種抑制作用的廣泛實(shí)施,當(dāng)然,基于成藥性的問題,PROTACS技術(shù)對(duì)于大分子往往需要較高的血藥濃度,而對(duì)于小分子往往也需要更高的全身暴露,從而實(shí)現(xiàn)抑制的作用??偟膩碚f,CDK降解途徑,當(dāng)前整體還處于臨床前階段,真正的品種上市之路,還需要一段時(shí)間。(注:該方向在研的熱門CDK亞型為靶點(diǎn)CDK9)

       ☆ 可逆競爭性抑制劑

       通常是采用HTS的手段來獲取CDK可逆競爭性抑制劑,尤其是亞型最為火熱的CDK4/6抑制劑,且開發(fā)的重點(diǎn)仍然為活性、選擇性和腦滲透性。而除了CDK4/6抑制劑外,開發(fā)較為火熱的還有CDK2、CDK8、CDK9、CDK12等;尤其是針對(duì)于CDK8的開發(fā),結(jié)構(gòu)多樣性極為豐富;而針對(duì)CDK12的開發(fā),已經(jīng)有很多大公司介入,如武田和阿斯利康2018年報(bào)道的首批CDK12抑制劑。

       04  結(jié)論與展望

       過去的十幾年,CDK抑制劑領(lǐng)域的藥物發(fā)現(xiàn)取得了巨大的進(jìn)步,尤其是選擇性雙重CDK4/6抑制劑已顯示出強(qiáng)大的臨床療效和安全性。他們改變了CDK作為癌癥治療靶點(diǎn)的觀念,并將CDK研究集中在選擇性抑制劑上。尤其是針對(duì)變構(gòu)口袋、非活性構(gòu)象、蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用以及共價(jià)配體、PROTACS或ADC的替代藥物等策略,將進(jìn)一步為克服選擇性問題提供更多的機(jī)會(huì),從而允許開發(fā)出可以探究與CDK相關(guān)的新作用機(jī)制的新型CDK抑制劑。且由于細(xì)胞周期對(duì)于惡性腫瘤的特殊作用,該循環(huán)也勢(shì)必大概率產(chǎn)出類似于CDK4/6抑制劑的重磅品種,值得深入研究與期待。

       參考:

       1. CDK抑制劑在抗腫瘤領(lǐng)域的研發(fā)進(jìn)展.《藥學(xué)進(jìn)展》

       2. European Journal of Medicinal Chemistry. doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.01.003

       3. Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters. doi.org/10.1016/j.ejmech.2019.01.003.

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