近年來,人工智能技術(shù)的快速發(fā)展,為生命科學(xué)領(lǐng)域帶來了新的可能性。深勢科技也在不斷探索AI為藥物設(shè)計帶來的變革。5月27日,深勢科技Hermite®夏季發(fā)布會在蘇州圓滿落幕。Hermite®致力于為藥物研發(fā)工作者提供數(shù)據(jù)、算法、算力三位一體的一站式解決方案,通過提供有價值的計算設(shè)計工具,成為藥物研發(fā)工作者的“手”、“眼”、“腦”?,F(xiàn)場,眾多業(yè)內(nèi)重要專家和代表性企業(yè)齊聚,見證深勢科技新算法成果及新一代藥物計算設(shè)計平臺Hermite®新功能的發(fā)布。同時,關(guān)于抗體、RNA及合成生物學(xué)三大熱門領(lǐng)域的前沿思想,也在這里交匯、碰撞出新的火花。
會上,中國科學(xué)院院士、北京科學(xué)智能研究院院長鄂維南首先進(jìn)行開場致辭。鄂維南表示:當(dāng)前人工智能技術(shù)的應(yīng)用已經(jīng)成功的滲透到了各個領(lǐng)域。AI for Science作為引領(lǐng)當(dāng)下科學(xué)技術(shù)革命的重要驅(qū)動力,正在為合成生物學(xué)以及抗體和RNA研究等在內(nèi)的眾多領(lǐng)域帶來新的解決方案。開展這一類的研究,離不開分子模擬實驗預(yù)測理論創(chuàng)新等等,這也是人工智能帶來的新的機會所在。
鄂維南指出:AI for Science已經(jīng)進(jìn)入了預(yù)訓(xùn)練模型時代,這使得利用大數(shù)據(jù)和算法的力量對生物大分子進(jìn)行深度挖掘變得更加可行和高效。通過構(gòu)建生物網(wǎng)模型能夠為分析生物大分子之間的相互作用、研究RNA的調(diào)控等等提供更加有力的支持。AI for Science的底層算法對于優(yōu)化藥物設(shè)計、預(yù)測藥物的作用,降低藥物研發(fā)成本具有很大的幫助,這也是深勢科技在不斷突破的重點方向之一。今天發(fā)布的 Hermite®生物大分子解決方案就是深勢科技基于[多尺度建模+機器學(xué)習(xí)+高性能計算]等科學(xué)研究的新范式在微觀工業(yè)設(shè)計領(lǐng)域推出的新產(chǎn)品。人工智能的技術(shù)發(fā)展已經(jīng)逐步成熟,不過 AI 能為生命科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)做的遠(yuǎn)遠(yuǎn)不止于此。AI 技術(shù)在大分子相關(guān)研究中的應(yīng)用還在不斷完善。AI 模型的準(zhǔn)確性和可靠性以及可解釋性還需要進(jìn)一步的提高,AI 技術(shù)和實驗驗證相結(jié)合將為藥物研發(fā)持續(xù)提供更為可靠的依據(jù)。
隨后,深勢科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰介紹了深勢科技基于AI for Science的新算法。
孫偉杰首先簡單介紹了預(yù)訓(xùn)練模型的原理和應(yīng)用。在大分子研發(fā)中,序列、結(jié)構(gòu)、動力學(xué)這三類預(yù)訓(xùn)練模型都有非常大的開發(fā)空間。他陸續(xù)介紹了深勢科技基于序列的結(jié)構(gòu)和動力學(xué)預(yù)測、基于序列的蛋白性質(zhì)預(yù)測、基于結(jié)構(gòu)和動力學(xué)的蛋白性質(zhì)預(yù)測,以及RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測等深勢自研的多個性質(zhì)預(yù)測模型,效果遠(yuǎn)超此前算法。孫偉杰表示,得益于包括DPA、Uni-Mol、Uni-Fold在內(nèi)的一系列AI4S預(yù)訓(xùn)練模型的發(fā)展,當(dāng)前我們在生物醫(yī)藥領(lǐng)域面臨的機遇,就像2018年2019年泛AI領(lǐng)域面臨的機遇一樣,AI4S已進(jìn)入預(yù)訓(xùn)練模型時代。深勢科技將蓄力打造生物醫(yī)藥的GPT,為行業(yè)研發(fā)提供新起點。選擇Hermite®,就是選擇了強悍的組織保障,也是選擇與AI新時代接軌。
在強大算法體系的支撐下,深勢科技的產(chǎn)品也在不斷迭代、超越。Hermite®是深勢科技近年來在AI for Science領(lǐng)域深耕和集大成的平臺產(chǎn)品,去年10月,深勢科技在上海重磅發(fā)布新一代藥物計算設(shè)計平臺Hermite®,如今,Hermite®迎來了全新升級。
基于深勢科技AI for Science新算法,公司藥物設(shè)計平臺產(chǎn)品負(fù)責(zé)人徐濤博士發(fā)布了Hermite®產(chǎn)品新功能。對于大分子研發(fā)領(lǐng)域,Hermite®新增生物大分子整體解決方案,實現(xiàn)了從序列分析到結(jié)構(gòu)預(yù)測,結(jié)構(gòu)預(yù)測到功能分析,及基于功能分析后的生物大分子設(shè)計的全流程功能。
在可視化方面,Hermite® 體驗全新升級,新增的分子展示體驗?zāi)軌驇椭幬镅邪l(fā)科學(xué)家更好地展現(xiàn)、查看、構(gòu)建和優(yōu)化預(yù)測結(jié)果的2D和3D結(jié)構(gòu)。
在小分子藥物研發(fā)領(lǐng)域, 基于深勢科技最新算法成果,Hermite®上線了Uni-QSAR,一個集合預(yù)訓(xùn)練模型的、多維度表征分子的、多模型自動集成的功能?;赨ni-Mol預(yù)訓(xùn)練模型,Uni-QSAR 不僅有效解決了傳統(tǒng)QSAR領(lǐng)域中:有標(biāo)簽數(shù)據(jù)“稀缺”、分子表征能力低、手動調(diào)參、模型單一等挑戰(zhàn),其多模型集成的高效并行流程及資源調(diào)度模型,更極大降低了建模的成本,提高了建模的速度,在諸如分子性質(zhì)預(yù)測等任務(wù)的標(biāo)準(zhǔn)測試下,結(jié)果達(dá)到SOTA[1]。此外,Hermite®也進(jìn)一步優(yōu)化和豐富了其核心功能Uni-FEP,Uni-Aquasite的實際應(yīng)用場景,提升了穩(wěn)定性和準(zhǔn)確性的同時,大幅提高平臺操作友好性和便捷性。
圍繞近期熱門領(lǐng)域,大會還開展了生物藥創(chuàng)新論壇、RNA前沿論壇、合成生物學(xué)論壇等三場別開生面的討論,十余位嘉賓進(jìn)行了深入交流、探討。在上海交通大學(xué)藥學(xué)院院長張翱的主持下,晶泰科技聯(lián)合創(chuàng)始人&CEO馬健、火山引擎醫(yī)療健康行業(yè)解決方案總監(jiān)楊旭東、沙礫生物創(chuàng)始人&首席執(zhí)行官劉雅容、華為云中國區(qū)生物醫(yī)藥行業(yè)總經(jīng)理樸雪花、諾納生物CTO何云圍繞生物藥創(chuàng)新展開了討論。圍繞RNA前沿話題,楷拓生物聯(lián)合創(chuàng)始人&CEO王瀟、礪博生物創(chuàng)始人&CEO詹劍、思合基因聯(lián)合創(chuàng)始人黨云琨、維亞生物高級副總裁蔡建華、艾博生物計算生物負(fù)責(zé)人陳榮華、竣蒞醫(yī)藥創(chuàng)始人&CEO徐軍、深勢科技大分子研發(fā)負(fù)責(zé)人溫翰進(jìn)行了深入交流。在合成生物學(xué)論壇中,芯宿科技聯(lián)合創(chuàng)始人&CSO董一名、麗合智造首席算法科學(xué)家邢華東、聚維元創(chuàng)聯(lián)合創(chuàng)始人&CTO李承、斯道資本資深投資經(jīng)理王博分享了各自觀點。
新藥研發(fā)長期背負(fù)著三座大山:高風(fēng)險、高投入、長周期。近年來,行業(yè)痛點愈發(fā)顯現(xiàn)、尋求突破愈發(fā)困難,藥物研發(fā)工作者也亟需升級自己的“武器庫”。深勢科技基于AI for Science新范式,創(chuàng)新成果頻出,未來也將在“持續(xù)創(chuàng)新,成就伙伴”的理念下,將Hermite®打造為新一代臨床前藥物設(shè)計綜合整體解決方案。
參考文獻(xiàn)
[1] Gao, Zhifeng, et al. "Uni-QSAR: an Auto-ML Tool for Molecular Property Prediction." arXiv preprint arXiv:2304.12239 (2023).
關(guān)于深勢科技
深勢科技致力于運用人工智能和分子模擬算法,結(jié)合先進(jìn)計算手段求解重要科學(xué)問題,為人類文明最基礎(chǔ)的生物醫(yī)藥、能源、材料和信息科學(xué)與工程研究打造新一代微尺度工業(yè)設(shè)計和仿真平臺。
我們開創(chuàng)性地提出了「多尺度建模+機器學(xué)習(xí)+高性能計算」的革命性科學(xué)研究新范式,并推出了Bohrium®微尺度科學(xué)計算云平臺、Hermite®藥物計算設(shè)計平臺、RiDYMO®強化動力學(xué)平臺及電池材料計算設(shè)計平臺等微尺度工業(yè)設(shè)計基礎(chǔ)設(shè)施,顛覆了現(xiàn)有研發(fā)模式,打造“計算引導(dǎo)實驗、實驗優(yōu)化設(shè)計”的全新范式。
深勢科技是國家高新技術(shù)企業(yè)、北京市“專精特新”中小企業(yè),總部位于北京,并在上海、深圳等城市布局研發(fā)中心。科研技術(shù)團(tuán)隊由中國科學(xué)院院士領(lǐng)銜,匯集了超百位數(shù)學(xué)、物理、化學(xué)、生物、材料、計算機等多個領(lǐng)域的優(yōu)秀青年科學(xué)家和工程師,其中公司的博士及博士后占比超過35%。核心成員獲得過2020年全球計算機高性能計算領(lǐng)域的最高獎項“戈登貝爾獎”,相關(guān)工作當(dāng)選2020年中國十大科技進(jìn)展和全球AI領(lǐng)域十大技術(shù)突破。
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