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CPHI制藥在線 資訊 Science子刊:陳正一團(tuán)隊開發(fā)靶向miRNA的基因編輯療法,治療遺傳性耳聾

Science子刊:陳正一團(tuán)隊開發(fā)靶向miRNA的基因編輯療法,治療遺傳性耳聾

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來源:生物世界
  2024-07-12
聽力損失是一種多因素疾病,在全世界范圍內(nèi)影響著數(shù)千萬人。導(dǎo)致聽力損失的單基因突變占所有先天性感音神經(jīng)性聽力損失的 50%以上,然而目前尚無獲批的藥物或生物療法來減緩或逆轉(zhuǎn)遺傳性耳聾。
       聽力損失是一種多因素疾病,在全世界范圍內(nèi)影響著數(shù)千萬人。導(dǎo)致聽力損失的單基因突變占所有先天性感音神經(jīng)性聽力損失的 50%以上,然而目前尚無獲批的藥物或生物療法來減緩或逆轉(zhuǎn)遺傳性耳聾。
       在這些耳聾相關(guān)基因中,miRNA是一類短的(約20-24nt)內(nèi)源性非編碼RNA,它們在蛋白質(zhì)編碼基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮關(guān)鍵作用,被認(rèn)為是內(nèi)耳發(fā)育的重要因素,也是正常聽力所必需的。具體而言,MIR96(miR-96)突變已被確定為人類和小鼠常染色體顯性遺傳非綜合征型耳聾50型(DFNA50)的致病因素。
       2024年7月10日,哈佛大學(xué)醫(yī)學(xué)院陳正一教授團(tuán)隊在 Science 子刊 Science Translational Medicine 上發(fā)表了題為:Targeted genome editing restores auditory function in adult mice with progressive hearing loss caused by a human microRNA mutation 的研究論文。
       該研究優(yōu)化了CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng),以特異性清除MIR96突變,使用腺相關(guān)病毒(AAV)將該基因編輯系統(tǒng)遞送至攜帶Mir9614C>A突變的成年小鼠耳蝸中,在聽力損失癥狀出現(xiàn)前和出現(xiàn)后均可促進(jìn)毛細(xì)胞存活并改善聽力。這些結(jié)果表明,靶向編輯miRNA可能是一種保護(hù)DFNA50患者聽力的有潛力的新策略。
Targeted genome editing restores auditory function in adult mice with progressive hearing loss caused by a human microRNA mutation 研究論文
      
       MIR96在內(nèi)耳的感覺細(xì)胞中特異性表達(dá),通過降低多個靶基因的mRNA的表達(dá),在耳蝸發(fā)育和聽力維持中發(fā)揮關(guān)鍵作用。MIR96種子區(qū)域的點(diǎn)突變會導(dǎo)致人類家族中具有顯性遺傳模式的進(jìn)行性聽力損失。在小鼠中的研究表明Mir96對正常毛細(xì)胞發(fā)育是必需的,而Mir96突變之所以導(dǎo)致聽力損失,是因?yàn)槠渫蛔兒螽a(chǎn)生了新的靶基因,而不是因?yàn)楣δ軉适?,因此,不能通過導(dǎo)入正確的Mir96來進(jìn)行治療。
       針對顯性MIR96突變,基因組編輯技術(shù)顯示出了巨大前景。此前,通過遞送CRISPR-Cas9基因編輯系統(tǒng),已在多種聽力損失疾病小鼠模型中證明了破壞顯性等位基因的有效性。劉如謙團(tuán)隊也證實(shí)了堿基編輯可以修復(fù)耳聾小鼠模型的Tmc1基因顯性突變。
       在所有關(guān)于遺傳性聽力損失的基因編輯研究中,干預(yù)都是在耳蝸未成熟的新生小鼠中進(jìn)行的。相比之下,人類新生兒的內(nèi)耳是完全發(fā)育的,小鼠耳蝸從新生到成年階段會經(jīng)歷發(fā)育變化,包括大小、結(jié)構(gòu)和功能的變化。這種差異突出了需要評估成熟耳蝸中基因組編輯治療的療效、安全性和時間窗口,以確定潛在臨床應(yīng)用干預(yù)的可行性。 
       在這項(xiàng)研究中,研究團(tuán)隊通過非同源DNA末端連接(NHEJ)進(jìn)行編輯,以在患有聽力損失的年輕成年小鼠中靶向顯性Mir96突變(Mir96tm3.1Wtsi,在該研究中稱為 Mir9614C>A),通過腺相關(guān)病毒(AAV)進(jìn)行遞送。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AAV介導(dǎo)的基因編輯復(fù)合物的遞送具有良好的耐受性,且不會損害正常聽力。
       研究團(tuán)隊篩選了不同的基因編輯器,并確定了一個優(yōu)化的編輯器,從而在體外和體內(nèi)實(shí)現(xiàn)了高效且特異性的基因編輯。研究團(tuán)隊在聽力損失發(fā)生之前和之后測試了干預(yù)措施,并確定了治療能使聽力持續(xù)保持的時間窗口。
       具體來說,使用AAV2遞送saCas9的KKH變體(SaCas9-KKH)和sgRNA,在聽力損失發(fā)生前(3周齡)和聽力損失發(fā)生后(6周齡)的成年Mir9614C>A/+突變小鼠中均長期改善了聽力,在3周時治療效果更好。
      
AAV2-SaCas9-KKH-sgRNA4遞送到成年Mir9614C>A/+小鼠的耳蝸中,可促進(jìn)毛細(xì)胞存活以及維持靜纖毛的完整性

AAV2-SaCas9-KKH-sgRNA4遞送到成年Mir9614C>A/+小鼠的耳蝸中,可促進(jìn)毛細(xì)胞存活以及維持靜纖毛的完整性

       為了提高編輯策略的安全性,研究團(tuán)隊確定了在未檢測到AAV整合的劑量范圍,結(jié)果顯示,SaCas9-KKH的瞬時表達(dá)在注射12周后結(jié)束,沒有發(fā)現(xiàn)AAV基因組整合的證據(jù),表明這種體內(nèi)基因組編輯策略的安全性良好。
       由于人類和小鼠的Mir96在種子區(qū)域的序列100%相同,研究團(tuán)隊開發(fā)了一種雙AAV系統(tǒng),攜帶了靶向目前所有已知的人類MIR96突變的sgRNA,從而能夠靶向多種MIR96突變,為其潛在的推廣和廣泛應(yīng)用提供了證據(jù)。
      
攜帶多個sgRNA的雙AAV系統(tǒng),可有效靶向人類細(xì)胞中所有已知的MIR96種子區(qū)突變

攜帶多個sgRNA的雙AAV系統(tǒng),可有效靶向人類細(xì)胞中所有已知的MIR96種子區(qū)突變

       總的來說,該研究確立了體內(nèi)基因組編輯作為治療成年動物基因突變引起的聽力損失的可行方法的可行性。為開發(fā)由MIR96突變引起的DFNA50患者的治療方法奠定了基礎(chǔ)。
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