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CPHI制藥在線 資訊 云天 肺腺癌天然候選藥物分子:6-甲氧基二氫血根堿

肺腺癌天然候選藥物分子:6-甲氧基二氫血根堿

作者:云天  來源:CPHI制藥在線
  2024-07-15
肺癌是全球癌癥死亡的主要原因,其中肺腺癌(LUAD)是非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中最常見的類型。本文中的研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對接和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證對6-MDS進(jìn)行了全面評估,揭示其在治療肺腺癌(LUAD)方面的治療作用和機(jī)制,表明6-MDS可能成為治療LUAD的候選藥物。

       肺癌是全球最常見的惡性腫瘤之一,主要由約85%的非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)和15%的小細(xì)胞肺癌(SCLC)組成。根據(jù)2024年發(fā)布的《2022年全球癌癥統(tǒng)計(jì)》,2022年全球新增近250萬例肺癌病例,超過180萬人死于肺癌,肺癌是癌癥發(fā)病率和死亡率的首要原因。另一項(xiàng)研究預(yù)測,到2050年,全球?qū)⑿略?80萬例肺癌病例,并導(dǎo)致320萬人死亡。目前,肺腺癌(LUAD)是NSCLC最常見的亞型。盡管化療、放療和手術(shù)有所改進(jìn),但面臨化療藥物耐藥、不良反應(yīng)嚴(yán)重等多種挑戰(zhàn)。靶向治療和免疫治療已被開發(fā)出來以克服這些問題,但仍然面臨獲得性耐藥、治療效果不佳和系統(tǒng)性免疫功能障礙等問題。

       6-甲氧基二氫血根堿(6-MDS)屬于異喹啉類生物堿,研究表明,6-MDS能誘導(dǎo)HT29和Hep G2細(xì)胞增殖和凋亡,此外還能通過抑制PI3K/AKT/mTOR信號通路并積累ROS來誘導(dǎo)乳腺癌MCF-7細(xì)胞凋亡和自噬,顯示出在癌癥治療中的巨大潛力。同時(shí),6-MDS還通過ROS介導(dǎo)的DR5上調(diào)表現(xiàn)出對肝癌細(xì)胞的細(xì)胞毒性和對TRAIL誘導(dǎo)凋亡的增敏作用。最近的一項(xiàng)研究證實(shí),6-MDS對肺腺癌(LUAD)具有選擇性抑制作用,是一款潛在的肺腺癌候選藥物分子。

       如圖1所示,為了驗(yàn)證6-MDS對肺癌(LUAD)的抗增殖作用,研究采用CCK8試劑盒分別在6-MDS處理24小時(shí)和48小時(shí)后測定細(xì)胞存活率。結(jié)果顯示,6-MDS對LUAD細(xì)胞增殖有明顯的抑制作用,LUAD細(xì)胞的存活率呈劑量依賴性下降(圖1A-B)。

6-MDS對A549細(xì)胞存活率影響

       圖1 6-MDS對A549細(xì)胞存活率影響

       接著,研究人員對肺腺癌治療靶標(biāo)和6-MDS的作用靶標(biāo)進(jìn)行了分析。如圖2所示,通過GEPIA數(shù)據(jù)庫中的TCGA-LUAD隊(duì)列,共識(shí)別出4246個(gè)差異表達(dá)基因(DEGs),其中包括1112個(gè)上調(diào)基因和3134個(gè)下調(diào)基因(圖2A)。此外,從Drugbank、GeneCards和OMIM這三個(gè)數(shù)據(jù)庫中提取了9642個(gè)LUAD靶點(diǎn)。最后,通過韋恩分析獲得了522個(gè)與LUAD相關(guān)的靶點(diǎn)。對于6-MDS的靶點(diǎn),從PharmMapper、SuperPred、SwissTargetPrediction和targetnet這四個(gè)平臺(tái)中共獲得了379個(gè)目標(biāo)基因。通過將肺腺癌(LUAD)相關(guān)靶點(diǎn)與6-MDS靶點(diǎn)進(jìn)行交叉比對。確定了33個(gè)6-MDS在LUAD中的潛在靶點(diǎn)。KEGG富集分析結(jié)果顯示,這些基因在細(xì)胞周期、嘧啶代謝以及癌癥中的轉(zhuǎn)錄失調(diào)方面顯著富集(如圖2C)。而GO分析則表明,這33個(gè)潛在靶點(diǎn)與肺腺癌中細(xì)胞周期的G2/M期轉(zhuǎn)換、對傷口的反應(yīng)以及對β-淀粉樣蛋白的反應(yīng)顯著相關(guān)(如圖2D)。這些結(jié)果表明,6-MDS可能主要通過影響細(xì)胞周期來抑制肺腺癌的發(fā)生。

TCGA隊(duì)列中LUAD的差異表達(dá)基因(DEGs)及功能富集分析

       圖2 TCGA隊(duì)列中LUAD的差異表達(dá)基因(DEGs)及功能富集分析

       通過蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)分析(圖3A),研究人員找出了十個(gè)核心基因包括MMP9、CDK1、TYMS、CCNA2、ERBB2、CHEK1、KIF11、AURKB、PLK1和TTK。進(jìn)一步的KEGG富集分析表明,這些核心基因主要參與細(xì)胞周期和癌癥信號通路(圖3C)。

核心基因的PPI網(wǎng)絡(luò)和KEGG分析

       圖3 核心基因的PPI網(wǎng)絡(luò)和KEGG分析

       分子對接結(jié)果顯示,除了AURKB外,6-MDS與核心蛋白的結(jié)合能均高于-6 kcal/Mol,表明6-MDS與其中9個(gè)靶點(diǎn)之間有很強(qiáng)的親和力。特別地,6-MDS與PLK1的結(jié)合能為-11.90 kcal/mol,是10個(gè)核心基因中最低的對接能。

 分子對接數(shù)據(jù)

       圖4 分子對接數(shù)據(jù)

       GEPIA結(jié)果顯示,對于肺腺癌(LUAD),其他9個(gè)核心基因的mRNA表達(dá)水平在癌組織中遠(yuǎn)高于正常組織(圖5)。此外,隨著LUAD的進(jìn)展,CDK1、CCNA2、CHEK1、KIF11、PLK1和TTK的表達(dá)水平顯著升高。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),與基因表達(dá)模式一致,CDK1、TYMS、CCNA2的蛋白表達(dá)水平相比正常肺組織顯著上調(diào)??偵嫫诜治霰砻?,包括CDK1、TYMS、CCNA2、CHEK1、KIF11、PLK1和TTK在內(nèi)的8個(gè)核心基因的高表達(dá)與LUAD患者的總生存期(OS)顯著相關(guān)。甲基化水平分析顯示,與正常組織相比,LUAD組織中TYMS、ERBB2、CHEK1、KIF11、PLK1和TTK的啟動(dòng)子甲基化水平顯著降低。免疫細(xì)胞浸潤研究發(fā)現(xiàn),CCNA2、CDK1和TTK的表達(dá)與CD8+T細(xì)胞和中性粒細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān),而與B細(xì)胞和CD4+T細(xì)胞的浸潤呈負(fù)相關(guān)。CHEK1和KIF11的表達(dá)與中性粒細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān),而與B細(xì)胞的浸潤呈負(fù)相關(guān)。對于ERBB2,其表達(dá)水平與CD8+T細(xì)胞的浸潤呈負(fù)相關(guān),而與B細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān)。PLK1和TYMS的表達(dá)與中性粒細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān),而與B細(xì)胞的浸潤呈負(fù)相關(guān)。MMP9的表達(dá)與腫瘤純度呈負(fù)相關(guān),而與B細(xì)胞、CD4+T細(xì)胞、巨噬細(xì)胞、中性粒細(xì)胞和樹突狀細(xì)胞的浸潤呈正相關(guān)。

       由于CDK1、CHEK1、KIF11、PLK1和TTK在LUAD進(jìn)展中顯著升高,并且與6-MDS表現(xiàn)出優(yōu)異的結(jié)合性能,因此選擇它們進(jìn)行進(jìn)一步qPCR實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。qPCR結(jié)果顯示,在5 μM 6-MDS干預(yù)24小時(shí)后,與未處理組相比,CDK1、CHEK1、KIF11、PLK1和TTK的mRNA表達(dá)水平顯著降低(P < 0.05)(圖12A-E)。

 qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果

       圖5 qPCR實(shí)驗(yàn)結(jié)果

       肺癌是全球癌癥死亡的主要原因,其中肺腺癌(LUAD)是非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)中最常見的類型。盡管靶向治療和免疫治療取得了進(jìn)展,但LUAD患者的總體生存率仍有待提高。天然產(chǎn)物因其潛在的抗癌作用而備受關(guān)注,是創(chuàng)新藥物的開發(fā)開辟道路。本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對接和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證對6-MDS進(jìn)行了全面評估,揭示其在治療肺腺癌(LUAD)方面的治療作用和機(jī)制,表明6-MDS可能成為治療LUAD的候選藥物。

       參考文獻(xiàn):

       1.Global cancer statistics 2022: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. 2024.

       2.Exploring the mechanism of 6-Methoxydihydrosanguinarine in the treatment of lung adenocarcinoma based on network pharmacology, molecular docking and experimental investigation.2024.

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